RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.87■■□□□ 1.73
TTLL3-210ENST00000427220 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.87■■□□□ 1.73
TTLL3-210ENST00000427220 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
TTLL3-210ENST00000427220 SHROOM2Q13796 1616 aa25.86■■□□□ 1.73
TTLL3-210ENST00000427220 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
TTLL3-210ENST00000427220 CABP2Q9NPB3 220 aa25.84■■□□□ 1.73
TTLL3-210ENST00000427220 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
TTLL3-210ENST00000427220 RGS3P49796 1198 aa25.84■■□□□ 1.73
TTLL3-210ENST00000427220 GOLGA2Q08379 1002 aa25.83■■□□□ 1.73
TTLL3-210ENST00000427220 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
TTLL3-210ENST00000427220 NOS1P29475 1434 aa25.83■■□□□ 1.72
TTLL3-210ENST00000427220 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.82■■□□□ 1.72
TTLL3-210ENST00000427220 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.82■■□□□ 1.72
TTLL3-210ENST00000427220 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
TTLL3-210ENST00000427220 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.81■■□□□ 1.72
TTLL3-210ENST00000427220 CD109Q6YHK3 1445 aa25.81■■□□□ 1.72
TTLL3-210ENST00000427220 UNC13BO14795 1591 aa25.81■■□□□ 1.72
TTLL3-210ENST00000427220 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
TTLL3-210ENST00000427220 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.81■■□□□ 1.72
TTLL3-210ENST00000427220 PDE3BQ13370 1112 aa25.8■■□□□ 1.72
TTLL3-210ENST00000427220 BCAR3O75815 825 aa25.8■■□□□ 1.72
TTLL3-210ENST00000427220 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
TTLL3-210ENST00000427220 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.79■■□□□ 1.72
TTLL3-210ENST00000427220 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
TTLL3-210ENST00000427220 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
TTLL3-210ENST00000427220 ATP7AQ04656 1500 aa25.78■■□□□ 1.72
TTLL3-210ENST00000427220 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.78■■□□□ 1.72
TTLL3-210ENST00000427220 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
TTLL3-210ENST00000427220 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.77■■□□□ 1.72
TTLL3-210ENST00000427220 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
TTLL3-210ENST00000427220 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.72
TTLL3-210ENST00000427220 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.76■■□□□ 1.71
TTLL3-210ENST00000427220 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
TTLL3-210ENST00000427220 PLXNC1O60486 1568 aa25.75■■□□□ 1.71
TTLL3-210ENST00000427220 BCL11AQ9H165 835 aa25.75■■□□□ 1.71
TTLL3-210ENST00000427220 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
TTLL3-210ENST00000427220 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
TTLL3-210ENST00000427220 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
TTLL3-210ENST00000427220 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
TTLL3-210ENST00000427220 E9PCH4 1651 aa25.73■■□□□ 1.71
TTLL3-210ENST00000427220 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.73■■□□□ 1.71
TTLL3-210ENST00000427220 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.72■■□□□ 1.71
TTLL3-210ENST00000427220 IDI1Q13907 227 aa25.71■■□□□ 1.71
TTLL3-210ENST00000427220 POGKQ9P215 609 aa25.71■■□□□ 1.71
TTLL3-210ENST00000427220 CLTCL1P53675 1640 aa25.71■■□□□ 1.71
TTLL3-210ENST00000427220 PDE4AP27815 886 aa25.71■■□□□ 1.71
TTLL3-210ENST00000427220 MTHFSP49914 203 aa25.71■■□□□ 1.71
TTLL3-210ENST00000427220 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.71■■□□□ 1.71
TTLL3-210ENST00000427220 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.7■■□□□ 1.71
TTLL3-210ENST00000427220 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.7■■□□□ 1.7
TTLL3-210ENST00000427220 FBLN1P23142 703 aa25.7■■□□□ 1.7
TTLL3-210ENST00000427220 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
TTLL3-210ENST00000427220 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.69■■□□□ 1.7
TTLL3-210ENST00000427220 SLC4A3P48751 1232 aa25.69■■□□□ 1.7
TTLL3-210ENST00000427220 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.68■■□□□ 1.7
TTLL3-210ENST00000427220 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.65■■□□□ 1.7
TTLL3-210ENST00000427220 PANK1Q8TE04 598 aa25.65■■□□□ 1.7
TTLL3-210ENST00000427220 COG6Q9Y2V7 657 aa25.63■■□□□ 1.69
TTLL3-210ENST00000427220 PTPRTO14522 1441 aa25.63■■□□□ 1.69
TTLL3-210ENST00000427220 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.63■■□□□ 1.69
TTLL3-210ENST00000427220 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
TTLL3-210ENST00000427220 TRPM2O94759 1503 aa25.61■■□□□ 1.69
TTLL3-210ENST00000427220 SLFN5Q08AF3 891 aa25.61■■□□□ 1.69
TTLL3-210ENST00000427220 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
TTLL3-210ENST00000427220 NPATQ14207 1427 aa25.6■■□□□ 1.69
TTLL3-210ENST00000427220 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.6■■□□□ 1.69
TTLL3-210ENST00000427220 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
TTLL3-210ENST00000427220 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
TTLL3-210ENST00000427220 NUTM2FA1L443 756 aa25.59■■□□□ 1.69
TTLL3-210ENST00000427220 TNNQ9UQP3 1299 aa25.59■■□□□ 1.69
TTLL3-210ENST00000427220 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
TTLL3-210ENST00000427220 PRAM1Q96QH2 718 aa25.59■■□□□ 1.69
TTLL3-210ENST00000427220 MADDQ8WXG6 1647 aa25.59■■□□□ 1.69
TTLL3-210ENST00000427220 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
TTLL3-210ENST00000427220 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.56■■□□□ 1.68
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.56■■□□□ 1.68
TTLL3-210ENST00000427220 STAC3Q96MF2 364 aa25.56■■□□□ 1.68
TTLL3-210ENST00000427220 ERVK-7P63135 1459 aa25.55■■□□□ 1.68
TTLL3-210ENST00000427220 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
TTLL3-210ENST00000427220 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.54■■□□□ 1.68
TTLL3-210ENST00000427220 WWC1Q8IX03 1113 aa25.54■■□□□ 1.68
TTLL3-210ENST00000427220 CFAP53Q96M91 514 aa25.54■■□□□ 1.68
TTLL3-210ENST00000427220 EVC2Q86UK5 1308 aa25.53■■□□□ 1.68
TTLL3-210ENST00000427220 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
TTLL3-210ENST00000427220 SOX12O15370 315 aa25.52■■□□□ 1.68
TTLL3-210ENST00000427220 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.52■■□□□ 1.68
TTLL3-210ENST00000427220 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.51■■□□□ 1.67
TTLL3-210ENST00000427220 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
TTLL3-210ENST00000427220 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.5■■□□□ 1.67
TTLL3-210ENST00000427220 E9PSI1 815 aa25.49■■□□□ 1.67
TTLL3-210ENST00000427220 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
TTLL3-210ENST00000427220 BACH2Q9BYV9 841 aa25.48■■□□□ 1.67
TTLL3-210ENST00000427220 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
TTLL3-210ENST00000427220 CABP1Q9NZU7 370 aa25.46■■□□□ 1.67
TTLL3-210ENST00000427220 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.46■■□□□ 1.67
TTLL3-210ENST00000427220 TET3O43151 1660 aa25.45■■□□□ 1.66
TTLL3-210ENST00000427220 RUNDC1Q96C34 613 aa25.44■■□□□ 1.66
TTLL3-210ENST00000427220 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.43■■□□□ 1.66
TTLL3-210ENST00000427220 IGHDP01880 384 aa25.43■■□□□ 1.66
TTLL3-210ENST00000427220 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
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