RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422596.1

TRDN-203, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 3

Gene TRDN, Length 776 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-203ENST00000422596 COPS2P61201 443 aa9.08□□□□□ -0.96
TRDN-203ENST00000422596 TMEM134Q9H6X4 195 aa9.08□□□□□ -0.96
TRDN-203ENST00000422596 GPR37O15354 613 aa9.07□□□□□ -0.96
TRDN-203ENST00000422596 NKX2-3Q8TAU0 364 aa9.07□□□□□ -0.96
TRDN-203ENST00000422596 HIC1Q14526 733 aa9.06□□□□□ -0.96
TRDN-203ENST00000422596 SLC4A3P48751 1232 aa9.05□□□□□ -0.96
TRDN-203ENST00000422596 PXYLP1Q8TE99 480 aa9.05□□□□□ -0.96
TRDN-203ENST00000422596 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
TRDN-203ENST00000422596 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.04□□□□□ -0.96
TRDN-203ENST00000422596 LMOD2Q6P5Q4 547 aa9.04□□□□□ -0.96
TRDN-203ENST00000422596 NECTIN2Q92692 538 aa9.04□□□□□ -0.96
TRDN-203ENST00000422596 GNPATO15228 680 aa9.03□□□□□ -0.96
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TRDN-203ENST00000422596 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
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TRDN-203ENST00000422596 ZPR1O75312 459 aa9□□□□□ -0.97
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TRDN-203ENST00000422596 NLRP7Q8WX94 980 aa9□□□□□ -0.97
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TRDN-203ENST00000422596 PHOX2BQ99453 314 aa8.97□□□□□ -0.97
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TRDN-203ENST00000422596 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
TRDN-203ENST00000422596 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
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TRDN-203ENST00000422596 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
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TRDN-203ENST00000422596 GFRA3O60609 400 aa8.89□□□□□ -0.99
TRDN-203ENST00000422596 Q6ZNB5 142 aa8.89□□□□□ -0.99
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TRDN-203ENST00000422596 ZMYND10O75800 440 aa8.88□□□□□ -0.99
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TRDN-203ENST00000422596 ADH1BP00325 375 aa8.86□□□□□ -0.99
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TRDN-203ENST00000422596 MORN1Q5T089 497 aa8.84□□□□□ -0.99
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TRDN-203ENST00000422596 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.81□□□□□ -1
TRDN-203ENST00000422596 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.81□□□□□ -1
TRDN-203ENST00000422596 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.81□□□□□ -1
TRDN-203ENST00000422596 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.81□□□□□ -1
TRDN-203ENST00000422596 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
TRDN-203ENST00000422596 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
TRDN-203ENST00000422596 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
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TRDN-203ENST00000422596 THAP11Q96EK4 314 aa8.8□□□□□ -1
TRDN-203ENST00000422596 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
TRDN-203ENST00000422596 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.79□□□□□ -1
TRDN-203ENST00000422596 CD46P15529 392 aa8.78□□□□□ -1
TRDN-203ENST00000422596 SPRYD7Q5W111 196 aa8.78□□□□□ -1
TRDN-203ENST00000422596 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
TRDN-203ENST00000422596 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.78□□□□□ -1
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TRDN-203ENST00000422596 PRDM9Q9NQV7 894 aa8.76□□□□□ -1.01
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TRDN-203ENST00000422596 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.75□□□□□ -1.01
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TRDN-203ENST00000422596 KDM4AO75164 1064 aa8.72□□□□□ -1.01
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TRDN-203ENST00000422596 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
TRDN-203ENST00000422596 TNFRSF10AO00220 468 aa8.71□□□□□ -1.02
TRDN-203ENST00000422596 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.71□□□□□ -1.02
TRDN-203ENST00000422596 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
TRDN-203ENST00000422596 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.71□□□□□ -1.02
TRDN-203ENST00000422596 GDF9O60383 454 aa8.7□□□□□ -1.02
TRDN-203ENST00000422596 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
TRDN-203ENST00000422596 TRIM66O15016 1216 aa8.69□□□□□ -1.02
TRDN-203ENST00000422596 CLCN1P35523 988 aa8.69□□□□□ -1.02
TRDN-203ENST00000422596 PRR20EP86478 221 aa8.68□□□□□ -1.02
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