RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418674.1

PTPRC-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-207ENST00000418674 KCNC4Q03721 635 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-207ENST00000418674 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-207ENST00000418674 PRR14Q9BWN1 585 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-207ENST00000418674 APLP1P51693 650 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-207ENST00000418674 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-207ENST00000418674 A0A0G2JS52 829 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-207ENST00000418674 MTRQ99707 1265 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-207ENST00000418674 MAP2K5Q13163 448 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-207ENST00000418674 KMT5BQ4FZB7 885 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-207ENST00000418674 RSPH4AQ5TD94 716 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-207ENST00000418674 LMOD2Q6P5Q4 547 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-207ENST00000418674 IL21Q9HBE4 155 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-207ENST00000418674 TJAP1Q5JTD0 557 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-207ENST00000418674 RGS20O76081 388 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-207ENST00000418674 CFHP08603 1231 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-207ENST00000418674 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-207ENST00000418674 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-207ENST00000418674 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-207ENST00000418674 COPS2P61201 443 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-207ENST00000418674 BCANQ96GW7 911 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-207ENST00000418674 IRF6O14896 467 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-207ENST00000418674 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-207ENST00000418674 SLC10A3P09131 477 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-207ENST00000418674 RDH13Q8NBN7 331 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-207ENST00000418674 NLRP7Q8WX94 980 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-207ENST00000418674 PHOX2BQ99453 314 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-207ENST00000418674 DDX11L8A8MPP1 907 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-207ENST00000418674 SULF1Q8IWU6 871 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF516Q92618 1163 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-207ENST00000418674 CCDC102AQ96A19 550 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-207ENST00000418674 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-207ENST00000418674 ZPR1O75312 459 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-207ENST00000418674 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-207ENST00000418674 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-207ENST00000418674 NR1I2O75469 434 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-207ENST00000418674 GGCXP38435 758 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-207ENST00000418674 BARGINQ6ZT62 677 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-207ENST00000418674 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-207ENST00000418674 ZMYND10O75800 440 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-207ENST00000418674 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-207ENST00000418674 NKX2-3Q8TAU0 364 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-207ENST00000418674 PPP1R18Q6NYC8 613 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-207ENST00000418674 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-207ENST00000418674 TLL1O43897 1013 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-207ENST00000418674 CLCN1P35523 988 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-207ENST00000418674 GCGRP47871 477 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-207ENST00000418674 FUT2Q10981 343 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-207ENST00000418674 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-207ENST00000418674 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-207ENST00000418674 ATP6V1AP38606 617 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-207ENST00000418674 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-207ENST00000418674 ADH1BP00325 375 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-207ENST00000418674 CD46P15529 392 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-207ENST00000418674 GRIPAP1Q4V328 841 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-207ENST00000418674 MORN1Q5T089 497 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-207ENST00000418674 SCUBE3Q8IX30 993 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-207ENST00000418674 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-207ENST00000418674 PRKD2Q9BZL6 878 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-207ENST00000418674 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-207ENST00000418674 KDM4AO75164 1064 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-207ENST00000418674 S1PR4O95977 384 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-207ENST00000418674 AMHR2Q16671 573 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-207ENST00000418674 SPSB2Q99619 263 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-207ENST00000418674 SLC6A16Q9GZN6 736 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-207ENST00000418674 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-207ENST00000418674 RNF223E7ERA6 249 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-207ENST00000418674 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-207ENST00000418674 USP46P62068 366 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-207ENST00000418674 AK7Q96M32 723 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-207ENST00000418674 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-207ENST00000418674 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-207ENST00000418674 ANKLE1Q8NAG6 615 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-207ENST00000418674 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-207ENST00000418674 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-207ENST00000418674 Q3C1V9 767 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-207ENST00000418674 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-207ENST00000418674 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-207ENST00000418674 THAP11Q96EK4 314 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-207ENST00000418674 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-207ENST00000418674 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-207ENST00000418674 TRIM66O15016 1216 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-207ENST00000418674 HOXA2O43364 376 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-207ENST00000418674 BRICD5Q6PL45 260 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-207ENST00000418674 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-207ENST00000418674 SLC19A1P41440 591 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-207ENST00000418674 MSS51Q4VC12 460 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-207ENST00000418674 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-207ENST00000418674 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-207ENST00000418674 LAPTM4AQ15012 233 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-207ENST00000418674 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-207ENST00000418674 HLA-CQ95604 372 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-207ENST00000418674 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-207ENST00000418674 Q6ZNB5 142 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-207ENST00000418674 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-207ENST00000418674 BEGAINQ9BUH8 593 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-207ENST00000418674 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-207ENST00000418674 GUCA2AQ02747 115 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-207ENST00000418674 PDE4DQ08499 809 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-207ENST00000418674 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-207ENST00000418674 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
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