RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP1-202ENST00000417536 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP1-202ENST00000417536 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP1-202ENST00000417536 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP1-202ENST00000417536 NEO1Q92859 1461 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP1-202ENST00000417536 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
SH3BP1-202ENST00000417536 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.89■■□□□ 1.57
SH3BP1-202ENST00000417536 TET3O43151 1660 aa24.89■■□□□ 1.57
SH3BP1-202ENST00000417536 TESK2Q96S53 571 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BP1-202ENST00000417536 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SH3BP1-202ENST00000417536 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SH3BP1-202ENST00000417536 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BP1-202ENST00000417536 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SH3BP1-202ENST00000417536 RICTORQ6R327 1708 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP1-202ENST00000417536 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SH3BP1-202ENST00000417536 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP1-202ENST00000417536 PANK3Q9H999 370 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP1-202ENST00000417536 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SH3BP1-202ENST00000417536 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP1-202ENST00000417536 MLECQ14165 292 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SH3BP1-202ENST00000417536 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP1-202ENST00000417536 PDE3BQ13370 1112 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP1-202ENST00000417536 TRPM2O94759 1503 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP1-202ENST00000417536 TMF1P82094 1093 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP1-202ENST00000417536 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP1-202ENST00000417536 NPATQ14207 1427 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP1-202ENST00000417536 LAMC1P11047 1609 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP1-202ENST00000417536 PTPRTO14522 1441 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP1-202ENST00000417536 NBR1Q14596 966 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP1-202ENST00000417536 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SH3BP1-202ENST00000417536 GLI2P10070 1586 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP1-202ENST00000417536 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP1-202ENST00000417536 PLIN1O60240 522 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SH3BP1-202ENST00000417536 MROH2AA6NES4 1674 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3BP1-202ENST00000417536 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SH3BP1-202ENST00000417536 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCC3O15438 1527 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SH3BP1-202ENST00000417536 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
SH3BP1-202ENST00000417536 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP1-202ENST00000417536 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
SH3BP1-202ENST00000417536 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SH3BP1-202ENST00000417536 MADDQ8WXG6 1647 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF1BO60333 1816 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP1-202ENST00000417536 INSRP06213 1382 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP1-202ENST00000417536 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP1-202ENST00000417536 PDE4AP27815 886 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP1-202ENST00000417536 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP1-202ENST00000417536 NOS1P29475 1434 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP1-202ENST00000417536 CRBNQ96SW2 442 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP1-202ENST00000417536 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP1-202ENST00000417536 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP1-202ENST00000417536 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP2R1AP30153 589 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP1-202ENST00000417536 IDI1Q13907 227 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.53
SH3BP1-202ENST00000417536 SKAP1Q86WV1 359 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP1-202ENST00000417536 BACH2Q9BYV9 841 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP1-202ENST00000417536 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SH3BP1-202ENST00000417536 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP1-202ENST00000417536 SYNMO15061 1565 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP1-202ENST00000417536 MS4A1P11836 297 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP1-202ENST00000417536 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
SH3BP1-202ENST00000417536 IQGAP1P46940 1657 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP1-202ENST00000417536 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP1-202ENST00000417536 CDCA8Q53HL2 280 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP1-202ENST00000417536 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
SH3BP1-202ENST00000417536 ADGRB3O60242 1522 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP1-202ENST00000417536 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SH3BP1-202ENST00000417536 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP1-202ENST00000417536 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP1-202ENST00000417536 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.51
SH3BP1-202ENST00000417536 IFT172Q9UG01 1749 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA2Q08379 1002 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP1-202ENST00000417536 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP1-202ENST00000417536 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP1-202ENST00000417536 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP1-202ENST00000417536 STK26Q9P289 416 aa24.45■■□□□ 1.51
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF521Q96K83 1311 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP1-202ENST00000417536 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SH3BP1-202ENST00000417536 PPLO60437 1756 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP1-202ENST00000417536 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP1-202ENST00000417536 STAC3Q96MF2 364 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP1-202ENST00000417536 MYOM2P54296 1465 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP1-202ENST00000417536 MYOM1P52179 1685 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
SH3BP1-202ENST00000417536 PIK3C2GO75747 1445 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP1-202ENST00000417536 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP1-202ENST00000417536 PIK3C2BO00750 1634 aa24.39■■□□□ 1.5
SH3BP1-202ENST00000417536 SLFN5Q08AF3 891 aa24.39■■□□□ 1.5
SH3BP1-202ENST00000417536 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
SH3BP1-202ENST00000417536 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
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