RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413409.6

PTPRC-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-206ENST00000413409 RXRBP28702 533 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRC-206ENST00000413409 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRC-206ENST00000413409 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.39■■□□□ 1.66
PTPRC-206ENST00000413409 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRC-206ENST00000413409 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.35■■□□□ 1.65
PTPRC-206ENST00000413409 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
PTPRC-206ENST00000413409 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PTPRC-206ENST00000413409 BCANQ96GW7 911 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRC-206ENST00000413409 SHPRHQ149N8 1683 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRC-206ENST00000413409 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PTPRC-206ENST00000413409 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PTPRC-206ENST00000413409 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PTPRC-206ENST00000413409 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PTPRC-206ENST00000413409 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRC-206ENST00000413409 KIF15Q9NS87 1388 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRC-206ENST00000413409 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
PTPRC-206ENST00000413409 AFF2P51816 1311 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRC-206ENST00000413409 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRC-206ENST00000413409 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRC-206ENST00000413409 ADGRB3O60242 1522 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRC-206ENST00000413409 RGS12O14924 1447 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRC-206ENST00000413409 ERBINQ96RT1 1412 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRC-206ENST00000413409 DIP2AQ14689 1571 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRC-206ENST00000413409 NOS1P29475 1434 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRC-206ENST00000413409 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRC-206ENST00000413409 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PTPRC-206ENST00000413409 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRC-206ENST00000413409 ZFYVE9O95405 1425 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRC-206ENST00000413409 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRC-206ENST00000413409 C14orf37Q86TY3 774 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRC-206ENST00000413409 KANK1Q14678 1352 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRC-206ENST00000413409 BRINP3Q76B58 766 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRC-206ENST00000413409 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRC-206ENST00000413409 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRC-206ENST00000413409 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PTPRC-206ENST00000413409 TBX22Q9Y458 520 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRC-206ENST00000413409 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRC-206ENST00000413409 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRC-206ENST00000413409 ABCC5O15440 1437 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRC-206ENST00000413409 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRC-206ENST00000413409 ATF3P18847 181 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRC-206ENST00000413409 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PTPRC-206ENST00000413409 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PTPRC-206ENST00000413409 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRC-206ENST00000413409 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRC-206ENST00000413409 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRC-206ENST00000413409 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRC-206ENST00000413409 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRC-206ENST00000413409 C8orf37Q96NL8 207 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRC-206ENST00000413409 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRC-206ENST00000413409 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRC-206ENST00000413409 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRC-206ENST00000413409 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRC-206ENST00000413409 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRC-206ENST00000413409 ITGAEP38570 1179 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRC-206ENST00000413409 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRC-206ENST00000413409 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PTPRC-206ENST00000413409 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PTPRC-206ENST00000413409 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRC-206ENST00000413409 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRC-206ENST00000413409 PTPRUQ92729 1446 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRC-206ENST00000413409 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
PTPRC-206ENST00000413409 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRC-206ENST00000413409 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRC-206ENST00000413409 DAPK1P53355 1430 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRC-206ENST00000413409 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRC-206ENST00000413409 PIK3R4Q99570 1358 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRC-206ENST00000413409 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRC-206ENST00000413409 EP400Q96L91 3159 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRC-206ENST00000413409 HFM1A2PYH4 1435 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRC-206ENST00000413409 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25■■□□□ 1.59
PTPRC-206ENST00000413409 MST1RQ04912 1400 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRC-206ENST00000413409 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
PTPRC-206ENST00000413409 NGLY1Q96IV0 654 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRC-206ENST00000413409 ADAMTS2O95450 1211 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRC-206ENST00000413409 DCCP43146 1447 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRC-206ENST00000413409 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRC-206ENST00000413409 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
PTPRC-206ENST00000413409 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
PTPRC-206ENST00000413409 FOXD1Q16676 465 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRC-206ENST00000413409 USP21Q9UK80 565 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRC-206ENST00000413409 TRPM2O94759 1503 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRC-206ENST00000413409 NAIPQ13075 1403 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRC-206ENST00000413409 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PTPRC-206ENST00000413409 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
PTPRC-206ENST00000413409 ATRNO75882 1429 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRC-206ENST00000413409 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
PTPRC-206ENST00000413409 UNC13BO14795 1591 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRC-206ENST00000413409 CCDC125Q86Z20 511 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRC-206ENST00000413409 ROCK1Q13464 1354 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRC-206ENST00000413409 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRC-206ENST00000413409 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRC-206ENST00000413409 ADGRL2O95490 1459 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRC-206ENST00000413409 METP08581 1390 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRC-206ENST00000413409 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRC-206ENST00000413409 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PTPRC-206ENST00000413409 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRC-206ENST00000413409 PTCH1Q13635 1447 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
PTPRC-206ENST00000413409 ORAI2Q96SN7 254 aa24.75■■□□□ 1.55
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