RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409483.5

PTPRN2-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-205ENST00000409483 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
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PTPRN2-205ENST00000409483 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
PTPRN2-205ENST00000409483 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.73■□□□□ 0.91
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PTPRN2-205ENST00000409483 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.7■□□□□ 0.9
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PTPRN2-205ENST00000409483 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
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PTPRN2-205ENST00000409483 MAP3K1Q13233 1512 aa20.64■□□□□ 0.89
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PTPRN2-205ENST00000409483 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.6■□□□□ 0.89
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PTPRN2-205ENST00000409483 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.51■□□□□ 0.87
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PTPRN2-205ENST00000409483 WWC1Q8IX03 1113 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRN2-205ENST00000409483 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRN2-205ENST00000409483 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRN2-205ENST00000409483 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRN2-205ENST00000409483 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRN2-205ENST00000409483 ZNF428Q96B54 188 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRN2-205ENST00000409483 PSME1Q06323 249 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRN2-205ENST00000409483 SLFN5Q08AF3 891 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRN2-205ENST00000409483 NSD3Q9BZ95 1437 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRN2-205ENST00000409483 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20.39■□□□□ 0.85
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