RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409178.5

C10orf55-201, Transcript of chromosome 10 open reading frame 55, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C10orf55, Length 2,513 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55-201ENST00000409178 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
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C10orf55-201ENST00000409178 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.68■■■□□ 2.18
C10orf55-201ENST00000409178 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.67■■■□□ 2.18
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C10orf55-201ENST00000409178 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.59■■■□□ 2.17
C10orf55-201ENST00000409178 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.59■■■□□ 2.17
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C10orf55-201ENST00000409178 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.59■■■□□ 2.17
C10orf55-201ENST00000409178 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.55■■■□□ 2.16
C10orf55-201ENST00000409178 ZNF521Q96K83 1311 aa28.55■■■□□ 2.16
C10orf55-201ENST00000409178 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.54■■■□□ 2.16
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C10orf55-201ENST00000409178 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.46■■■□□ 2.15
C10orf55-201ENST00000409178 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
C10orf55-201ENST00000409178 GLI2P10070 1586 aa28.45■■■□□ 2.14
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C10orf55-201ENST00000409178 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.43■■■□□ 2.14
C10orf55-201ENST00000409178 MORC1Q86VD1 984 aa28.41■■■□□ 2.14
C10orf55-201ENST00000409178 ERICH6Q7L0X2 663 aa28.4■■■□□ 2.14
C10orf55-201ENST00000409178 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.39■■■□□ 2.14
C10orf55-201ENST00000409178 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
C10orf55-201ENST00000409178 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.37■■■□□ 2.13
C10orf55-201ENST00000409178 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
C10orf55-201ENST00000409178 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.37■■■□□ 2.13
C10orf55-201ENST00000409178 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
C10orf55-201ENST00000409178 EVC2Q86UK5 1308 aa28.35■■■□□ 2.13
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C10orf55-201ENST00000409178 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.34■■■□□ 2.13
C10orf55-201ENST00000409178 STK26Q9P289 416 aa28.34■■■□□ 2.13
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