RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 VPS8Q8N3P4 1428 aa8.72□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 KCNA6P17658 529 aa8.72□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRIM52Q96A61 297 aa8.72□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa8.72□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 NHSL1Q5SYE7 1610 aa8.72□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa8.72□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 JCADQ9P266 1359 aa8.72□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 E9PCH4 1651 aa8.72□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 DAPK1P53355 1430 aa8.71□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 EID1Q9Y6B2 187 aa8.7□□□□□ -1.02
RNU6-171P-201ENST00000384354 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RNU6-171P-201ENST00000384354 MSH6P52701 1360 aa8.7□□□□□ -1.02
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa8.7□□□□□ -1.02
RNU6-171P-201ENST00000384354 NALCNQ8IZF0 1738 aa8.69□□□□□ -1.02
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLAIN2Q9P270 581 aa8.69□□□□□ -1.02
RNU6-171P-201ENST00000384354 PTPRUQ92729 1446 aa8.69□□□□□ -1.02
RNU6-171P-201ENST00000384354 UNC13BO14795 1591 aa8.69□□□□□ -1.02
RNU6-171P-201ENST00000384354 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.68□□□□□ -1.02
RNU6-171P-201ENST00000384354 RGS12O14924 1447 aa8.68□□□□□ -1.02
RNU6-171P-201ENST00000384354 RIMS2Q9UQ26 1411 aa8.68□□□□□ -1.02
RNU6-171P-201ENST00000384354 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
RNU6-171P-201ENST00000384354 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa8.67□□□□□ -1.02
RNU6-171P-201ENST00000384354 STAG3Q9UJ98 1225 aa8.67□□□□□ -1.02
RNU6-171P-201ENST00000384354 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa8.67□□□□□ -1.02
RNU6-171P-201ENST00000384354 FGD6Q6ZV73 1430 aa8.66□□□□□ -1.02
RNU6-171P-201ENST00000384354 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa8.65□□□□□ -1.02
RNU6-171P-201ENST00000384354 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RNU6-171P-201ENST00000384354 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa8.65□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRPM2O94759 1503 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADGRL2O95490 1459 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 KANK1Q14678 1352 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 AFF2P51816 1311 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 IQGAP3Q86VI3 1631 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 BRINP3Q76B58 766 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 BCANQ96GW7 911 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 MST1RQ04912 1400 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 BRWD3Q6RI45 1802 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 LAMC1P11047 1609 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 RXRBP28702 533 aa8.6□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 SETD5Q9C0A6 1442 aa8.6□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 PNPLA6Q8IY17 1366 aa8.6□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 C14orf37Q86TY3 774 aa8.59□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC52A1Q9NWF4 448 aa8.59□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 TBX22Q9Y458 520 aa8.59□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa8.59□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa8.59□□□□□ -1.03
RNU6-171P-201ENST00000384354 CLTCL1P53675 1640 aa8.58□□□□□ -1.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 C8orf37Q96NL8 207 aa8.58□□□□□ -1.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 METP08581 1390 aa8.58□□□□□ -1.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 CHGAP10645 457 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 C19orf44Q9H6X5 657 aa8.57□□□□□ -1.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa8.57□□□□□ -1.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 DCCP43146 1447 aa8.56□□□□□ -1.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATF3P18847 181 aa8.56□□□□□ -1.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 CADPS2Q86UW7 1296 aa8.56□□□□□ -1.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa8.56□□□□□ -1.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa8.55□□□□□ -1.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 PIK3R4Q99570 1358 aa8.55□□□□□ -1.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 KIF1BO60333 1816 aa8.54□□□□□ -1.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 GLI3P10071 1580 aa8.54□□□□□ -1.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 C1orf167Q5SNV9 1468 aa8.54□□□□□ -1.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADAMTS2O95450 1211 aa8.54□□□□□ -1.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATRNO75882 1429 aa8.53□□□□□ -1.04
RNU6-171P-201ENST00000384354 ABCA3Q99758 1704 aa8.52□□□□□ -1.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPLO60437 1756 aa8.52□□□□□ -1.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYOM2P54296 1465 aa8.51□□□□□ -1.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 PLCH1Q4KWH8 1693 aa8.51□□□□□ -1.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 ORAI2Q96SN7 254 aa8.51□□□□□ -1.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 BCL9LQ86UU0 1499 aa8.51□□□□□ -1.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATAD2Q6PL18 1390 aa8.5□□□□□ -1.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 LRP5O75197 1615 aa8.5□□□□□ -1.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 PXDNQ92626 1479 aa8.5□□□□□ -1.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 ROBO2Q9HCK4 1378 aa8.49□□□□□ -1.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 NGLY1Q96IV0 654 aa8.49□□□□□ -1.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP21Q9UK80 565 aa8.48□□□□□ -1.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 FMN2Q9NZ56 1722 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms