RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 SLC4A3P48751 1232 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
PTPRC-202ENST00000367364 DNAJB2P25686 324 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRC-202ENST00000367364 SPRYD7Q5W111 196 aa13.49□□□□□ -0.25
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PTPRC-202ENST00000367364 TMEM134Q9H6X4 195 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRC-202ENST00000367364 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
PTPRC-202ENST00000367364 MYT1Q01538 1121 aa13.46□□□□□ -0.25
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PTPRC-202ENST00000367364 ADGRG1Q9Y653 693 aa13.46□□□□□ -0.25
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PTPRC-202ENST00000367364 NLRP7Q8WX94 980 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRC-202ENST00000367364 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa13.06□□□□□ -0.32
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PTPRC-202ENST00000367364 CYP4X1Q8N118 509 aa13.05□□□□□ -0.32
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PTPRC-202ENST00000367364 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PTPRC-202ENST00000367364 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
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PTPRC-202ENST00000367364 PHOX2BQ99453 314 aa12.99□□□□□ -0.33
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PTPRC-202ENST00000367364 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa12.98□□□□□ -0.33
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PTPRC-202ENST00000367364 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
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