RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329146.8

CRIP2-201, Transcript of cysteine rich protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP2, Length 1,857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP2-201ENST00000329146 KIF1BO60333 1816 aa40.64■■■■■ 4.1
CRIP2-201ENST00000329146 MROH2AA6NES4 1674 aa40.62■■■■■ 4.09
CRIP2-201ENST00000329146 ADGRB3O60242 1522 aa40.62■■■■■ 4.09
CRIP2-201ENST00000329146 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa40.61■■■■■ 4.09
CRIP2-201ENST00000329146 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.61■■■■■ 4.09
CRIP2-201ENST00000329146 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.58■■■■■ 4.09
CRIP2-201ENST00000329146 NBPF1Q3BBV0 1214 aa40.51■■■■■ 4.08
CRIP2-201ENST00000329146 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
CRIP2-201ENST00000329146 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.48■■■■■ 4.07
CRIP2-201ENST00000329146 POLR3GLQ9BT43 218 aa40.45■■■■■ 4.07
CRIP2-201ENST00000329146 MADDQ8WXG6 1647 aa40.44■■■■■ 4.06
CRIP2-201ENST00000329146 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa40.43■■■■■ 4.06
CRIP2-201ENST00000329146 IFT172Q9UG01 1749 aa40.42■■■■■ 4.06
CRIP2-201ENST00000329146 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.42■■■■■ 4.06
CRIP2-201ENST00000329146 MYOM2P54296 1465 aa40.41■■■■■ 4.06
CRIP2-201ENST00000329146 TNRQ92752 1358 aa40.4■■■■■ 4.06
CRIP2-201ENST00000329146 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa40.39■■■■■ 4.06
CRIP2-201ENST00000329146 PLPPR3Q6T4P5 718 aa40.38■■■■■ 4.05
CRIP2-201ENST00000329146 C3P01024 1663 aa40.37■■■■■ 4.05
CRIP2-201ENST00000329146 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.35■■■■■ 4.05
CRIP2-201ENST00000329146 PPLO60437 1756 aa40.35■■■■■ 4.05
CRIP2-201ENST00000329146 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP40.34■■■■■ 4.05
CRIP2-201ENST00000329146 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.34■■■■■ 4.05
CRIP2-201ENST00000329146 MRS2Q9HD23 443 aa40.33■■■■■ 4.05
CRIP2-201ENST00000329146 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa40.33■■■■■ 4.05
CRIP2-201ENST00000329146 NRXN1Q9ULB1 1477 aa40.32■■■■■ 4.05
CRIP2-201ENST00000329146 CCDC184Q52MB2 194 aa40.3■■■■■ 4.04
CRIP2-201ENST00000329146 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.3■■■■■ 4.04
CRIP2-201ENST00000329146 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.29■■■■■ 4.04
CRIP2-201ENST00000329146 TESK2Q96S53 571 aa40.29■■■■■ 4.04
CRIP2-201ENST00000329146 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
CRIP2-201ENST00000329146 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP40.27■■■■■ 4.04
CRIP2-201ENST00000329146 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
CRIP2-201ENST00000329146 CFAP70Q5T0N1 1121 aa40.25■■■■■ 4.03
CRIP2-201ENST00000329146 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa40.25■■■■■ 4.03
CRIP2-201ENST00000329146 VGFO15240 615 aaPredicted RBP40.23■■■■■ 4.03
CRIP2-201ENST00000329146 PIK3C2GO75747 1445 aa40.22■■■■■ 4.03
CRIP2-201ENST00000329146 TMF1P82094 1093 aa40.22■■■■■ 4.03
CRIP2-201ENST00000329146 IQGAP1P46940 1657 aa40.2■■■■■ 4.03
CRIP2-201ENST00000329146 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
CRIP2-201ENST00000329146 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
CRIP2-201ENST00000329146 ZFYVE9O95405 1425 aa40.17■■■■■ 4.02
CRIP2-201ENST00000329146 NLRP1Q9C000 1473 aa40.16■■■■■ 4.02
CRIP2-201ENST00000329146 RALBP1Q15311 655 aa40.15■■■■■ 4.02
CRIP2-201ENST00000329146 FAM9BQ8IZU0 186 aa40.14■■■■■ 4.02
CRIP2-201ENST00000329146 DISP3Q9P2K9 1392 aa40.13■■■■■ 4.01
CRIP2-201ENST00000329146 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.01
CRIP2-201ENST00000329146 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
CRIP2-201ENST00000329146 RIMS2Q9UQ26 1411 aa40.12■■■■■ 4.01
CRIP2-201ENST00000329146 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.09■■■■■ 4.01
CRIP2-201ENST00000329146 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
CRIP2-201ENST00000329146 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
CRIP2-201ENST00000329146 SLC24A1O60721 1099 aa40.05■■■■■ 4
CRIP2-201ENST00000329146 CDCA8Q53HL2 280 aa40.05■■■■■ 4
CRIP2-201ENST00000329146 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
CRIP2-201ENST00000329146 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
CRIP2-201ENST00000329146 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.02■■■■■ 4
CRIP2-201ENST00000329146 TMEM132EQ6IEE7 984 aa40.01■■■■■ 4
CRIP2-201ENST00000329146 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40.01■■■■■ 4
CRIP2-201ENST00000329146 ZBED9Q6R2W3 1325 aa40■■■■□ 3.99
CRIP2-201ENST00000329146 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP40■■■■□ 3.99
CRIP2-201ENST00000329146 ADGRB1O14514 1584 aa39.99■■■■□ 3.99
CRIP2-201ENST00000329146 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa39.99■■■■□ 3.99
CRIP2-201ENST00000329146 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP39.97■■■■□ 3.99
CRIP2-201ENST00000329146 TMC1Q8TDI8 760 aa39.97■■■■□ 3.99
CRIP2-201ENST00000329146 PTPRMP28827 1452 aa39.97■■■■□ 3.99
CRIP2-201ENST00000329146 NEFLP07196 543 aa39.96■■■■□ 3.99
CRIP2-201ENST00000329146 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP39.96■■■■□ 3.99
CRIP2-201ENST00000329146 PARD3Q8TEW0 1356 aa39.95■■■■□ 3.99
CRIP2-201ENST00000329146 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP39.92■■■■□ 3.98
CRIP2-201ENST00000329146 PANK3Q9H999 370 aa39.92■■■■□ 3.98
CRIP2-201ENST00000329146 HDGFP51858 240 aaKnown RBP39.91■■■■□ 3.98
CRIP2-201ENST00000329146 LTKP29376 864 aa39.9■■■■□ 3.98
CRIP2-201ENST00000329146 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP39.89■■■■□ 3.98
CRIP2-201ENST00000329146 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.97
CRIP2-201ENST00000329146 ALKQ9UM73 1620 aa39.88■■■■□ 3.97
CRIP2-201ENST00000329146 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa39.88■■■■□ 3.97
CRIP2-201ENST00000329146 FKBP8Q14318 412 aa39.88■■■■□ 3.97
CRIP2-201ENST00000329146 TRAK1Q9UPV9 953 aa39.87■■■■□ 3.97
CRIP2-201ENST00000329146 NLRP13Q86W25 1043 aa39.85■■■■□ 3.97
CRIP2-201ENST00000329146 ARHGAP23Q9P227 1491 aa39.85■■■■□ 3.97
CRIP2-201ENST00000329146 SLIT1O75093 1534 aa39.84■■■■□ 3.97
CRIP2-201ENST00000329146 TXNDC2Q86VQ3 553 aa39.84■■■■□ 3.97
CRIP2-201ENST00000329146 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa39.81■■■■□ 3.96
CRIP2-201ENST00000329146 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
CRIP2-201ENST00000329146 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
CRIP2-201ENST00000329146 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa39.78■■■■□ 3.96
CRIP2-201ENST00000329146 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
CRIP2-201ENST00000329146 EID1Q9Y6B2 187 aa39.78■■■■□ 3.96
CRIP2-201ENST00000329146 STK26Q9P289 416 aa39.77■■■■□ 3.96
CRIP2-201ENST00000329146 BCANQ96GW7 911 aa39.75■■■■□ 3.95
CRIP2-201ENST00000329146 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
CRIP2-201ENST00000329146 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa39.75■■■■□ 3.95
CRIP2-201ENST00000329146 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa39.74■■■■□ 3.95
CRIP2-201ENST00000329146 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
CRIP2-201ENST00000329146 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP39.72■■■■□ 3.95
CRIP2-201ENST00000329146 KNSTRNQ9Y448 316 aa39.71■■■■□ 3.95
CRIP2-201ENST00000329146 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP39.71■■■■□ 3.95
CRIP2-201ENST00000329146 METP08581 1390 aa39.71■■■■□ 3.95
CRIP2-201ENST00000329146 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa39.69■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.8 ms