RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295057.3

LRRTM1-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM1, Length 2,599 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1-201ENST00000295057 TSPOAP1O95153 1857 aa20.5■□□□□ 0.87
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LRRTM1-201ENST00000295057 EFCAB6Q5THR3 1501 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRTM1-201ENST00000295057 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
LRRTM1-201ENST00000295057 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRTM1-201ENST00000295057 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
LRRTM1-201ENST00000295057 IL27Q8NEV9 243 aa20.48■□□□□ 0.87
LRRTM1-201ENST00000295057 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRTM1-201ENST00000295057 RICTORQ6R327 1708 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRTM1-201ENST00000295057 GPRASP1Q5JY77 1395 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRTM1-201ENST00000295057 NPATQ14207 1427 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRTM1-201ENST00000295057 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
LRRTM1-201ENST00000295057 NUDCQ9Y266 331 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRTM1-201ENST00000295057 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
LRRTM1-201ENST00000295057 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRTM1-201ENST00000295057 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRTM1-201ENST00000295057 TESK2Q96S53 571 aa20.43■□□□□ 0.86
LRRTM1-201ENST00000295057 LMTK2Q8IWU2 1503 aa20.43■□□□□ 0.86
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LRRTM1-201ENST00000295057 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.42■□□□□ 0.86
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LRRTM1-201ENST00000295057 ABCC3O15438 1527 aa20.41■□□□□ 0.86
LRRTM1-201ENST00000295057 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.41■□□□□ 0.86
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LRRTM1-201ENST00000295057 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.36■□□□□ 0.85
LRRTM1-201ENST00000295057 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
LRRTM1-201ENST00000295057 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
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LRRTM1-201ENST00000295057 TMF1P82094 1093 aa20.31■□□□□ 0.84
LRRTM1-201ENST00000295057 NEFMP07197 916 aa20.3■□□□□ 0.84
LRRTM1-201ENST00000295057 IDI1Q13907 227 aa20.3■□□□□ 0.84
LRRTM1-201ENST00000295057 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
LRRTM1-201ENST00000295057 ADGRB3O60242 1522 aa20.29■□□□□ 0.84
LRRTM1-201ENST00000295057 STAC3Q96MF2 364 aa20.29■□□□□ 0.84
LRRTM1-201ENST00000295057 PANK3Q9H999 370 aa20.28■□□□□ 0.84
LRRTM1-201ENST00000295057 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
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LRRTM1-201ENST00000295057 MYOM2P54296 1465 aa20.26■□□□□ 0.83
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LRRTM1-201ENST00000295057 NRXN1Q9ULB1 1477 aa20.21■□□□□ 0.83
LRRTM1-201ENST00000295057 REREQ9P2R6 1566 aa20.21■□□□□ 0.83
LRRTM1-201ENST00000295057 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa20.21■□□□□ 0.83
LRRTM1-201ENST00000295057 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
LRRTM1-201ENST00000295057 BACH2Q9BYV9 841 aa20.19■□□□□ 0.82
LRRTM1-201ENST00000295057 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
LRRTM1-201ENST00000295057 PIK3C2GO75747 1445 aa20.18■□□□□ 0.82
LRRTM1-201ENST00000295057 USP35Q9P2H5 1018 aa20.17■□□□□ 0.82
LRRTM1-201ENST00000295057 PIK3C2BO00750 1634 aa20.17■□□□□ 0.82
LRRTM1-201ENST00000295057 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.16■□□□□ 0.82
LRRTM1-201ENST00000295057 PPLO60437 1756 aa20.16■□□□□ 0.82
LRRTM1-201ENST00000295057 SKAP1Q86WV1 359 aa20.16■□□□□ 0.82
LRRTM1-201ENST00000295057 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.16■□□□□ 0.82
LRRTM1-201ENST00000295057 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
LRRTM1-201ENST00000295057 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.15■□□□□ 0.82
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LRRTM1-201ENST00000295057 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.15■□□□□ 0.82
LRRTM1-201ENST00000295057 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
LRRTM1-201ENST00000295057 RALBP1Q15311 655 aa20.15■□□□□ 0.82
LRRTM1-201ENST00000295057 AGLP35573 1532 aa20.14■□□□□ 0.81
LRRTM1-201ENST00000295057 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.13■□□□□ 0.81
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LRRTM1-201ENST00000295057 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.13■□□□□ 0.81
LRRTM1-201ENST00000295057 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa20.13■□□□□ 0.81
LRRTM1-201ENST00000295057 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.12■□□□□ 0.81
LRRTM1-201ENST00000295057 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
LRRTM1-201ENST00000295057 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.11■□□□□ 0.81
LRRTM1-201ENST00000295057 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
LRRTM1-201ENST00000295057 STK26Q9P289 416 aa20.11■□□□□ 0.81
LRRTM1-201ENST00000295057 ERVK-7P63135 1459 aa20.11■□□□□ 0.81
LRRTM1-201ENST00000295057 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
LRRTM1-201ENST00000295057 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
LRRTM1-201ENST00000295057 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
LRRTM1-201ENST00000295057 ADGRB1O14514 1584 aa20.1■□□□□ 0.81
LRRTM1-201ENST00000295057 MYO5BQ9ULV0 1848 aa20.09■□□□□ 0.81
LRRTM1-201ENST00000295057 CDCA8Q53HL2 280 aa20.09■□□□□ 0.81
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