RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294702.5

GFI1-201, Transcript of growth factor independent 1 transcriptional repressor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GFI1, Length 2,784 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1-201ENST00000294702 PANK1Q8TE04 598 aa24.86■■□□□ 1.57
GFI1-201ENST00000294702 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.85■■□□□ 1.57
GFI1-201ENST00000294702 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
GFI1-201ENST00000294702 TESK2Q96S53 571 aa24.84■■□□□ 1.57
GFI1-201ENST00000294702 DDX11L8A8MPP1 907 aa24.83■■□□□ 1.57
GFI1-201ENST00000294702 PPP2R1AP30153 589 aa24.83■■□□□ 1.57
GFI1-201ENST00000294702 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
GFI1-201ENST00000294702 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.82■■□□□ 1.56
GFI1-201ENST00000294702 NUP160Q12769 1436 aa24.82■■□□□ 1.56
GFI1-201ENST00000294702 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
GFI1-201ENST00000294702 PDE3AQ14432 1141 aa24.82■■□□□ 1.56
GFI1-201ENST00000294702 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.82■■□□□ 1.56
GFI1-201ENST00000294702 OFD1O75665 1012 aa24.81■■□□□ 1.56
GFI1-201ENST00000294702 AAMPQ13685 434 aa24.81■■□□□ 1.56
GFI1-201ENST00000294702 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
GFI1-201ENST00000294702 SHROOM2Q13796 1616 aa24.8■■□□□ 1.56
GFI1-201ENST00000294702 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.8■■□□□ 1.56
GFI1-201ENST00000294702 NUP155O75694 1391 aa24.8■■□□□ 1.56
GFI1-201ENST00000294702 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.79■■□□□ 1.56
GFI1-201ENST00000294702 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.78■■□□□ 1.56
GFI1-201ENST00000294702 GRIN2AQ12879 1464 aa24.77■■□□□ 1.56
GFI1-201ENST00000294702 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.77■■□□□ 1.56
GFI1-201ENST00000294702 APAF1O14727 1248 aa24.76■■□□□ 1.55
GFI1-201ENST00000294702 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.76■■□□□ 1.55
GFI1-201ENST00000294702 FAM13BQ9NYF5 915 aa24.76■■□□□ 1.55
GFI1-201ENST00000294702 ZSCAN30Q86W11 494 aa24.76■■□□□ 1.55
GFI1-201ENST00000294702 DDIT3P35638 169 aa24.75■■□□□ 1.55
GFI1-201ENST00000294702 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.74■■□□□ 1.55
GFI1-201ENST00000294702 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.74■■□□□ 1.55
GFI1-201ENST00000294702 PPP1R9BQ96SB3 815 aa24.73■■□□□ 1.55
GFI1-201ENST00000294702 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
GFI1-201ENST00000294702 E9PSI1 815 aa24.72■■□□□ 1.55
GFI1-201ENST00000294702 ADGRL2O95490 1459 aa24.72■■□□□ 1.55
GFI1-201ENST00000294702 ZMYM3Q14202 1370 aa24.71■■□□□ 1.55
GFI1-201ENST00000294702 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
GFI1-201ENST00000294702 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
GFI1-201ENST00000294702 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.71■■□□□ 1.55
GFI1-201ENST00000294702 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
GFI1-201ENST00000294702 CEP170Q5SW79 1584 aa24.71■■□□□ 1.55
GFI1-201ENST00000294702 TERF1P54274 439 aa24.71■■□□□ 1.55
GFI1-201ENST00000294702 CCDC173Q0VFZ6 552 aa24.71■■□□□ 1.55
GFI1-201ENST00000294702 ERBINQ96RT1 1412 aa24.7■■□□□ 1.55
GFI1-201ENST00000294702 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.7■■□□□ 1.54
GFI1-201ENST00000294702 OSCARQ8IYS5 282 aa24.7■■□□□ 1.54
GFI1-201ENST00000294702 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
GFI1-201ENST00000294702 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.69■■□□□ 1.54
GFI1-201ENST00000294702 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
GFI1-201ENST00000294702 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.69■■□□□ 1.54
GFI1-201ENST00000294702 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
GFI1-201ENST00000294702 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.68■■□□□ 1.54
GFI1-201ENST00000294702 MAP7D2Q96T17 732 aa24.68■■□□□ 1.54
GFI1-201ENST00000294702 TNNQ9UQP3 1299 aa24.68■■□□□ 1.54
GFI1-201ENST00000294702 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.68■■□□□ 1.54
GFI1-201ENST00000294702 TMF1P82094 1093 aa24.67■■□□□ 1.54
GFI1-201ENST00000294702 RGL3Q3MIN7 710 aa24.67■■□□□ 1.54
GFI1-201ENST00000294702 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
GFI1-201ENST00000294702 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.67■■□□□ 1.54
GFI1-201ENST00000294702 RLBP1P12271 317 aa24.66■■□□□ 1.54
GFI1-201ENST00000294702 HSCBQ8IWL3 235 aa24.66■■□□□ 1.54
GFI1-201ENST00000294702 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.66■■□□□ 1.54
GFI1-201ENST00000294702 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.65■■□□□ 1.54
GFI1-201ENST00000294702 NASPP49321 788 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
GFI1-201ENST00000294702 FGD1P98174 961 aa24.64■■□□□ 1.54
GFI1-201ENST00000294702 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
GFI1-201ENST00000294702 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.64■■□□□ 1.53
GFI1-201ENST00000294702 MSNP26038 577 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
GFI1-201ENST00000294702 ARID3AQ99856 593 aa24.63■■□□□ 1.53
GFI1-201ENST00000294702 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
GFI1-201ENST00000294702 RAB3GAP1Q15042 981 aa24.6■■□□□ 1.53
GFI1-201ENST00000294702 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
GFI1-201ENST00000294702 GBP4Q96PP9 640 aa24.59■■□□□ 1.53
GFI1-201ENST00000294702 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.59■■□□□ 1.53
GFI1-201ENST00000294702 PRDM10Q9NQV6 1147 aa24.59■■□□□ 1.53
GFI1-201ENST00000294702 UQCRHLA0A096LP55 91 aa24.59■■□□□ 1.53
GFI1-201ENST00000294702 UQCRHP07919 91 aa24.59■■□□□ 1.53
GFI1-201ENST00000294702 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
GFI1-201ENST00000294702 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
GFI1-201ENST00000294702 SMC5Q8IY18 1101 aa24.58■■□□□ 1.53
GFI1-201ENST00000294702 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
GFI1-201ENST00000294702 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
GFI1-201ENST00000294702 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
GFI1-201ENST00000294702 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
GFI1-201ENST00000294702 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
GFI1-201ENST00000294702 PIK3C2GO75747 1445 aa24.55■■□□□ 1.52
GFI1-201ENST00000294702 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
GFI1-201ENST00000294702 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
GFI1-201ENST00000294702 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.54■■□□□ 1.52
GFI1-201ENST00000294702 SNX21Q969T3 373 aa24.54■■□□□ 1.52
GFI1-201ENST00000294702 ABCC2Q92887 1545 aa24.54■■□□□ 1.52
GFI1-201ENST00000294702 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.54■■□□□ 1.52
GFI1-201ENST00000294702 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
GFI1-201ENST00000294702 WWC1Q8IX03 1113 aa24.53■■□□□ 1.52
GFI1-201ENST00000294702 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
GFI1-201ENST00000294702 IQGAP2Q13576 1575 aa24.53■■□□□ 1.52
GFI1-201ENST00000294702 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
GFI1-201ENST00000294702 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.52■■□□□ 1.52
GFI1-201ENST00000294702 PTPRGP23470 1445 aa24.52■■□□□ 1.52
GFI1-201ENST00000294702 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.51■■□□□ 1.51
GFI1-201ENST00000294702 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.51■■□□□ 1.51
GFI1-201ENST00000294702 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.9 ms