RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291532.7

TMPRSS3-201, Transcript of transmembrane serine protease 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMPRSS3, Length 3,193 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TMPRSS3-201ENST00000291532 FANCAO15360 1455 aa14.79□□□□□ -0.04
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TMPRSS3-201ENST00000291532 PREX2Q70Z35 1606 aa14.77□□□□□ -0.04
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TMPRSS3-201ENST00000291532 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.71□□□□□ -0.05
TMPRSS3-201ENST00000291532 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
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TMPRSS3-201ENST00000291532 RNF123Q5XPI4 1314 aa14.68□□□□□ -0.06
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TMPRSS3-201ENST00000291532 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.67□□□□□ -0.06
TMPRSS3-201ENST00000291532 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.67□□□□□ -0.06
TMPRSS3-201ENST00000291532 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.67□□□□□ -0.06
TMPRSS3-201ENST00000291532 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa14.67□□□□□ -0.06
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TMPRSS3-201ENST00000291532 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TMPRSS3-201ENST00000291532 MRE11P49959 708 aa14.61□□□□□ -0.07
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TMPRSS3-201ENST00000291532 PLA2R1Q13018 1463 aa14.6□□□□□ -0.07
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TMPRSS3-201ENST00000291532 TEX2Q8IWB9 1127 aa14.6□□□□□ -0.07
TMPRSS3-201ENST00000291532 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TMPRSS3-201ENST00000291532 TSPOAP1O95153 1857 aa14.58□□□□□ -0.08
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TMPRSS3-201ENST00000291532 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa14.58□□□□□ -0.08
TMPRSS3-201ENST00000291532 DUOX2Q9NRD8 1548 aa14.57□□□□□ -0.08
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TMPRSS3-201ENST00000291532 KANK1Q14678 1352 aa14.57□□□□□ -0.08
TMPRSS3-201ENST00000291532 ATP7AQ04656 1500 aa14.56□□□□□ -0.08
TMPRSS3-201ENST00000291532 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.56□□□□□ -0.08
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TMPRSS3-201ENST00000291532 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS3-201ENST00000291532 CFAP70Q5T0N1 1121 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS3-201ENST00000291532 ERBINQ96RT1 1412 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS3-201ENST00000291532 TMC1Q8TDI8 760 aa14.53□□□□□ -0.08
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TMPRSS3-201ENST00000291532 TMEM132EQ6IEE7 984 aa14.52□□□□□ -0.09
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