RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267260.4

SRRM4-201, Transcript of serine/arginine repetitive matrix 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRRM4, Length 8,477 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4-201ENST00000267260 CCP110O43303 1012 aa14.67□□□□□ -0.06
SRRM4-201ENST00000267260 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SRRM4-201ENST00000267260 RILPL2Q969X0 211 aa14.67□□□□□ -0.06
SRRM4-201ENST00000267260 CAGE1Q8TC20 777 aa14.67□□□□□ -0.06
SRRM4-201ENST00000267260 KIAA0754O94854 1291 aa14.67□□□□□ -0.06
SRRM4-201ENST00000267260 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SRRM4-201ENST00000267260 WWC1Q8IX03 1113 aa14.66□□□□□ -0.06
SRRM4-201ENST00000267260 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SRRM4-201ENST00000267260 NLRP13Q86W25 1043 aa14.65□□□□□ -0.06
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SRRM4-201ENST00000267260 TRDNQ13061 729 aa14.64□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa14.64□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 DEF6Q9H4E7 631 aa14.64□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 ERICH2A1L162 156 aa14.63□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 STK26Q9P289 416 aa14.63□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 UACAQ9BZF9 1416 aa14.63□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 OLFM4Q6UX06 510 aa14.63□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 CPLX1O14810 134 aa14.63□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 PRDM2Q13029 1718 aa14.63□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 BICD2Q8TD16 824 aa14.62□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 GOLGA6L10A6NI86 522 aa14.62□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 ANKRD45Q5TZF3 282 aa14.62□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 ERLIN2O94905 339 aa14.61□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.6□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.6□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.6□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 KIF7Q2M1P5 1343 aa14.6□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 NASPP49321 788 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.59□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 AMPHP49418 695 aa14.59□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.58□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 CHMP5Q9NZZ3 219 aa14.58□□□□□ -0.07
SRRM4-201ENST00000267260 SMARCE1Q969G3 411 aa14.58□□□□□ -0.08
SRRM4-201ENST00000267260 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.58□□□□□ -0.08
SRRM4-201ENST00000267260 FMN1Q68DA7 1419 aa14.58□□□□□ -0.08
SRRM4-201ENST00000267260 E9PSI1 815 aa14.58□□□□□ -0.08
SRRM4-201ENST00000267260 XBP1P17861 261 aa14.57□□□□□ -0.08
SRRM4-201ENST00000267260 TXLNBQ8N3L3 684 aa14.57□□□□□ -0.08
SRRM4-201ENST00000267260 PDE4AP27815 886 aa14.57□□□□□ -0.08
SRRM4-201ENST00000267260 ANO2Q9NQ90 1003 aa14.57□□□□□ -0.08
SRRM4-201ENST00000267260 OFD1O75665 1012 aa14.57□□□□□ -0.08
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SRRM4-201ENST00000267260 NINLQ9Y2I6 1382 aa14.56□□□□□ -0.08
SRRM4-201ENST00000267260 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SRRM4-201ENST00000267260 PKD2Q13563 968 aa14.56□□□□□ -0.08
SRRM4-201ENST00000267260 NGEFQ8N5V2 710 aa14.56□□□□□ -0.08
SRRM4-201ENST00000267260 VPS8Q8N3P4 1428 aa14.56□□□□□ -0.08
SRRM4-201ENST00000267260 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.55□□□□□ -0.08
SRRM4-201ENST00000267260 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SRRM4-201ENST00000267260 DDX19BQ9UMR2 479 aa14.55□□□□□ -0.08
SRRM4-201ENST00000267260 VPS37DQ86XT2 251 aa14.55□□□□□ -0.08
SRRM4-201ENST00000267260 AAMPQ13685 434 aa14.55□□□□□ -0.08
SRRM4-201ENST00000267260 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SRRM4-201ENST00000267260 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.55□□□□□ -0.08
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SRRM4-201ENST00000267260 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SRRM4-201ENST00000267260 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SRRM4-201ENST00000267260 EID1Q9Y6B2 187 aa14.55□□□□□ -0.08
SRRM4-201ENST00000267260 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.54□□□□□ -0.08
SRRM4-201ENST00000267260 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SRRM4-201ENST00000267260 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.54□□□□□ -0.08
SRRM4-201ENST00000267260 EZRP15311 586 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SRRM4-201ENST00000267260 RABEP1Q15276 862 aa14.53□□□□□ -0.08
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SRRM4-201ENST00000267260 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SRRM4-201ENST00000267260 ERC2O15083 957 aa14.51□□□□□ -0.09
SRRM4-201ENST00000267260 FILIP1LQ4L180 1135 aa14.51□□□□□ -0.09
SRRM4-201ENST00000267260 CCDC146Q8IYE0 955 aa14.51□□□□□ -0.09
SRRM4-201ENST00000267260 RRP9O43818 475 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SRRM4-201ENST00000267260 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa14.51□□□□□ -0.09
SRRM4-201ENST00000267260 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SRRM4-201ENST00000267260 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.5□□□□□ -0.09
SRRM4-201ENST00000267260 SYCP1Q15431 976 aa14.5□□□□□ -0.09
SRRM4-201ENST00000267260 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SRRM4-201ENST00000267260 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
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