RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264719.5

EFR3B-201, Transcript of EFR3 homolog B, humanhuman

TSL 5

Gene EFR3B, Length 1,980 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3B-201ENST00000264719 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.46■■□□□ 1.19
EFR3B-201ENST00000264719 STAC3Q96MF2 364 aa22.45■■□□□ 1.18
EFR3B-201ENST00000264719 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.44■■□□□ 1.18
EFR3B-201ENST00000264719 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.42■■□□□ 1.18
EFR3B-201ENST00000264719 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.42■■□□□ 1.18
EFR3B-201ENST00000264719 PPLO60437 1756 aa22.4■■□□□ 1.18
EFR3B-201ENST00000264719 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
EFR3B-201ENST00000264719 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.4■■□□□ 1.18
EFR3B-201ENST00000264719 LAMC1P11047 1609 aa22.4■■□□□ 1.18
EFR3B-201ENST00000264719 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.39■■□□□ 1.18
EFR3B-201ENST00000264719 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.39■■□□□ 1.17
EFR3B-201ENST00000264719 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.39■■□□□ 1.17
EFR3B-201ENST00000264719 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
EFR3B-201ENST00000264719 PIK3C2GO75747 1445 aa22.37■■□□□ 1.17
EFR3B-201ENST00000264719 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.37■■□□□ 1.17
EFR3B-201ENST00000264719 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.35■■□□□ 1.17
EFR3B-201ENST00000264719 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.34■■□□□ 1.17
EFR3B-201ENST00000264719 TESK2Q96S53 571 aa22.34■■□□□ 1.17
EFR3B-201ENST00000264719 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
EFR3B-201ENST00000264719 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.32■■□□□ 1.16
EFR3B-201ENST00000264719 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
EFR3B-201ENST00000264719 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
EFR3B-201ENST00000264719 IQGAP1P46940 1657 aa22.31■■□□□ 1.16
EFR3B-201ENST00000264719 TNRQ92752 1358 aa22.31■■□□□ 1.16
EFR3B-201ENST00000264719 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.31■■□□□ 1.16
EFR3B-201ENST00000264719 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
EFR3B-201ENST00000264719 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.3■■□□□ 1.16
EFR3B-201ENST00000264719 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.29■■□□□ 1.16
EFR3B-201ENST00000264719 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.27■■□□□ 1.16
EFR3B-201ENST00000264719 ADGRB1O14514 1584 aa22.26■■□□□ 1.15
EFR3B-201ENST00000264719 ZFYVE9O95405 1425 aa22.26■■□□□ 1.15
EFR3B-201ENST00000264719 ANP32CO43423 234 aa22.25■■□□□ 1.15
EFR3B-201ENST00000264719 C3P01024 1663 aa22.25■■□□□ 1.15
EFR3B-201ENST00000264719 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
EFR3B-201ENST00000264719 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.23■■□□□ 1.15
EFR3B-201ENST00000264719 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.23■■□□□ 1.15
EFR3B-201ENST00000264719 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.23■■□□□ 1.15
EFR3B-201ENST00000264719 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
EFR3B-201ENST00000264719 TMF1P82094 1093 aa22.19■■□□□ 1.14
EFR3B-201ENST00000264719 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.18■■□□□ 1.14
EFR3B-201ENST00000264719 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
EFR3B-201ENST00000264719 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.15■■□□□ 1.14
EFR3B-201ENST00000264719 STK26Q9P289 416 aa22.14■■□□□ 1.14
EFR3B-201ENST00000264719 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
EFR3B-201ENST00000264719 NLRP1Q9C000 1473 aa22.14■■□□□ 1.13
EFR3B-201ENST00000264719 ALKQ9UM73 1620 aa22.14■■□□□ 1.13
EFR3B-201ENST00000264719 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
EFR3B-201ENST00000264719 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.13■■□□□ 1.13
EFR3B-201ENST00000264719 PTPRMP28827 1452 aa22.12■■□□□ 1.13
EFR3B-201ENST00000264719 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.1■■□□□ 1.13
EFR3B-201ENST00000264719 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
EFR3B-201ENST00000264719 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.1■■□□□ 1.13
EFR3B-201ENST00000264719 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
EFR3B-201ENST00000264719 LTKP29376 864 aa22.08■■□□□ 1.13
EFR3B-201ENST00000264719 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
EFR3B-201ENST00000264719 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
EFR3B-201ENST00000264719 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.07■■□□□ 1.12
EFR3B-201ENST00000264719 CCER2I3L3R5 266 aa22.07■■□□□ 1.12
EFR3B-201ENST00000264719 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
EFR3B-201ENST00000264719 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
EFR3B-201ENST00000264719 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.05■■□□□ 1.12
EFR3B-201ENST00000264719 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.05■■□□□ 1.12
EFR3B-201ENST00000264719 PANK3Q9H999 370 aa22.05■■□□□ 1.12
EFR3B-201ENST00000264719 CCDC184Q52MB2 194 aa22.05■■□□□ 1.12
EFR3B-201ENST00000264719 BCANQ96GW7 911 aa22.04■■□□□ 1.12
EFR3B-201ENST00000264719 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
EFR3B-201ENST00000264719 METP08581 1390 aa22.04■■□□□ 1.12
EFR3B-201ENST00000264719 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
EFR3B-201ENST00000264719 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
EFR3B-201ENST00000264719 CDCA8Q53HL2 280 aa22.03■■□□□ 1.12
EFR3B-201ENST00000264719 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.03■■□□□ 1.12
EFR3B-201ENST00000264719 PRAM1Q96QH2 718 aa22.02■■□□□ 1.12
EFR3B-201ENST00000264719 MYOM1P52179 1685 aa22■■□□□ 1.11
EFR3B-201ENST00000264719 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.99■■□□□ 1.11
EFR3B-201ENST00000264719 SLIT1O75093 1534 aa21.98■■□□□ 1.11
EFR3B-201ENST00000264719 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
EFR3B-201ENST00000264719 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
EFR3B-201ENST00000264719 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.98■■□□□ 1.11
EFR3B-201ENST00000264719 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.97■■□□□ 1.11
EFR3B-201ENST00000264719 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
EFR3B-201ENST00000264719 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.97■■□□□ 1.11
EFR3B-201ENST00000264719 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.97■■□□□ 1.11
EFR3B-201ENST00000264719 POGKQ9P215 609 aa21.97■■□□□ 1.11
EFR3B-201ENST00000264719 EID1Q9Y6B2 187 aa21.97■■□□□ 1.11
EFR3B-201ENST00000264719 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
EFR3B-201ENST00000264719 SLC24A1O60721 1099 aa21.96■■□□□ 1.11
EFR3B-201ENST00000264719 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.96■■□□□ 1.11
EFR3B-201ENST00000264719 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.96■■□□□ 1.11
EFR3B-201ENST00000264719 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
EFR3B-201ENST00000264719 CABP2Q9NPB3 220 aa21.93■■□□□ 1.1
EFR3B-201ENST00000264719 ABCC11Q96J66 1382 aa21.93■■□□□ 1.1
EFR3B-201ENST00000264719 EVC2Q86UK5 1308 aa21.92■■□□□ 1.1
EFR3B-201ENST00000264719 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.91■■□□□ 1.1
EFR3B-201ENST00000264719 TMC1Q8TDI8 760 aa21.9■■□□□ 1.1
EFR3B-201ENST00000264719 MRS2Q9HD23 443 aa21.9■■□□□ 1.1
EFR3B-201ENST00000264719 DLC1Q96QB1 1528 aa21.9■■□□□ 1.1
EFR3B-201ENST00000264719 MED14O60244 1454 aa21.89■■□□□ 1.1
EFR3B-201ENST00000264719 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
EFR3B-201ENST00000264719 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
EFR3B-201ENST00000264719 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms