RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261497.8

USP22-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP22, Length 5,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-201ENST00000261497 GGNBP2Q9H3C7 697 aa17.1■□□□□ 0.33
USP22-201ENST00000261497 DCAF8L1A6NGE4 600 aa17.1■□□□□ 0.33
USP22-201ENST00000261497 PTMSP20962 102 aa17.1■□□□□ 0.33
USP22-201ENST00000261497 MIA2Q96PC5 1412 aa17.1■□□□□ 0.33
USP22-201ENST00000261497 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
USP22-201ENST00000261497 POGZQ7Z3K3 1410 aa17.09■□□□□ 0.33
USP22-201ENST00000261497 CUX1P39880 1505 aa17.09■□□□□ 0.33
USP22-201ENST00000261497 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
USP22-201ENST00000261497 APAF1O14727 1248 aa17.08■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 RIPK4P57078 832 aa17.08■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 VPS37DQ86XT2 251 aa17.08■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 VSIG10Q8N0Z9 540 aa17.08■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 RASSF8Q8NHQ8 419 aa17.08■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 CFAP70Q5T0N1 1121 aa17.07■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 STRN4Q9NRL3 753 aa17.07■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.07■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa17.07■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 VPS53Q5VIR6 699 aa17.07■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 E9PSI1 815 aa17.06■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 TRIM34Q9BYJ4 488 aa17.06■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa17.06■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 HMOX1P09601 288 aa17.06■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 CCDC34Q96HJ3 373 aa17.06■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 FBXW7Q969H0 707 aa17.05■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 MARCH6O60337 910 aa17.05■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa17.05■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 SLC26A8Q96RN1 970 aa17.05■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 RSPH6AQ9H0K4 717 aa17.05■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 TOPBP1Q92547 1522 aa17.05■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 NCOA2Q15596 1464 aa17.05■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 PIP4K2BP78356 416 aa17.05■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 SLC52A1Q9NWF4 448 aa17.05■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 FYCO1Q9BQS8 1478 aa17.04■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 TSPYL4Q9UJ04 414 aa17.04■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 AMOTL1Q8IY63 956 aa17.04■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 PRAM1Q96QH2 718 aa17.03■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 RAD21O60216 631 aa17.02■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 RILPL2Q969X0 211 aa17.02■□□□□ 0.32
USP22-201ENST00000261497 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
USP22-201ENST00000261497 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
USP22-201ENST00000261497 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
USP22-201ENST00000261497 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa17■□□□□ 0.31
USP22-201ENST00000261497 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
USP22-201ENST00000261497 KIF3AQ9Y496 699 aa17■□□□□ 0.31
USP22-201ENST00000261497 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa17■□□□□ 0.31
USP22-201ENST00000261497 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
USP22-201ENST00000261497 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
USP22-201ENST00000261497 ANKRD45Q5TZF3 282 aa16.99■□□□□ 0.31
USP22-201ENST00000261497 RIC3Q7Z5B4 369 aa16.98■□□□□ 0.31
USP22-201ENST00000261497 GNAI1P63096 354 aa16.98■□□□□ 0.31
USP22-201ENST00000261497 WASHC2AQ641Q2 1341 aa16.97■□□□□ 0.31
USP22-201ENST00000261497 KIF16BQ96L93 1317 aa16.97■□□□□ 0.31
USP22-201ENST00000261497 RUNDC1Q96C34 613 aa16.97■□□□□ 0.31
USP22-201ENST00000261497 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
USP22-201ENST00000261497 PRDM11Q9NQV5 511 aa16.97■□□□□ 0.31
USP22-201ENST00000261497 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP16.97■□□□□ 0.314e-7■■■■□ 24.8
USP22-201ENST00000261497 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa16.97■□□□□ 0.31
USP22-201ENST00000261497 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
USP22-201ENST00000261497 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
USP22-201ENST00000261497 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa16.96■□□□□ 0.31
USP22-201ENST00000261497 APPP05067 770 aa16.96■□□□□ 0.31
USP22-201ENST00000261497 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
USP22-201ENST00000261497 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
USP22-201ENST00000261497 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.3
USP22-201ENST00000261497 HMGXB3Q12766 1538 aa16.95■□□□□ 0.3
USP22-201ENST00000261497 TATP17735 454 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
USP22-201ENST00000261497 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa16.95■□□□□ 0.3
USP22-201ENST00000261497 COG6Q9Y2V7 657 aa16.94■□□□□ 0.3
USP22-201ENST00000261497 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16.94■□□□□ 0.3
USP22-201ENST00000261497 FAM177BA6PVY3 158 aa16.93■□□□□ 0.3
USP22-201ENST00000261497 ST18O60284 1047 aa16.93■□□□□ 0.3
USP22-201ENST00000261497 GAS2L2Q8NHY3 880 aa16.93■□□□□ 0.3
USP22-201ENST00000261497 MTHFSP49914 203 aa16.93■□□□□ 0.3
USP22-201ENST00000261497 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
USP22-201ENST00000261497 KIF21BO75037 1637 aa16.92■□□□□ 0.3
USP22-201ENST00000261497 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
USP22-201ENST00000261497 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
USP22-201ENST00000261497 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
USP22-201ENST00000261497 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa16.91■□□□□ 0.3
USP22-201ENST00000261497 DDX19BQ9UMR2 479 aa16.91■□□□□ 0.3
USP22-201ENST00000261497 PLIN1O60240 522 aa16.91■□□□□ 0.3
USP22-201ENST00000261497 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
USP22-201ENST00000261497 RUFY2Q8WXA3 655 aa16.91■□□□□ 0.3
USP22-201ENST00000261497 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
USP22-201ENST00000261497 CHMP4CQ96CF2 233 aa16.9■□□□□ 0.3
USP22-201ENST00000261497 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa16.9■□□□□ 0.3
USP22-201ENST00000261497 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
USP22-201ENST00000261497 GSE1Q14687 1217 aa16.9■□□□□ 0.3
USP22-201ENST00000261497 CDK19Q9BWU1 502 aa16.9■□□□□ 0.3
USP22-201ENST00000261497 HFM1A2PYH4 1435 aa16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms