RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259467.8

PDCL-201, Transcript of phosducin like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL, Length 2,813 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL-201ENST00000259467 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
PDCL-201ENST00000259467 REREQ9P2R6 1566 aa13.46□□□□□ -0.25
PDCL-201ENST00000259467 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
PDCL-201ENST00000259467 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa13.46□□□□□ -0.26
PDCL-201ENST00000259467 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
PDCL-201ENST00000259467 CHGAP10645 457 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
PDCL-201ENST00000259467 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PDCL-201ENST00000259467 CLTCL1P53675 1640 aa13.44□□□□□ -0.26
PDCL-201ENST00000259467 ZMYM3Q14202 1370 aa13.43□□□□□ -0.26
PDCL-201ENST00000259467 EFCAB6Q5THR3 1501 aa13.43□□□□□ -0.26
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PDCL-201ENST00000259467 BCANQ96GW7 911 aa13.43□□□□□ -0.26
PDCL-201ENST00000259467 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa13.43□□□□□ -0.26
PDCL-201ENST00000259467 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
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PDCL-201ENST00000259467 TESK2Q96S53 571 aa13.42□□□□□ -0.26
PDCL-201ENST00000259467 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa13.42□□□□□ -0.26
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PDCL-201ENST00000259467 IFT172Q9UG01 1749 aa13.41□□□□□ -0.26
PDCL-201ENST00000259467 RALBP1Q15311 655 aa13.41□□□□□ -0.26
PDCL-201ENST00000259467 RNF123Q5XPI4 1314 aa13.41□□□□□ -0.26
PDCL-201ENST00000259467 STAC3Q96MF2 364 aa13.4□□□□□ -0.26
PDCL-201ENST00000259467 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
PDCL-201ENST00000259467 IDI1Q13907 227 aa13.4□□□□□ -0.26
PDCL-201ENST00000259467 NBPF1Q3BBV0 1214 aa13.4□□□□□ -0.26
PDCL-201ENST00000259467 INSRP06213 1382 aa13.4□□□□□ -0.26
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PDCL-201ENST00000259467 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa13.37□□□□□ -0.27
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PDCL-201ENST00000259467 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
PDCL-201ENST00000259467 KIF1BO60333 1816 aa13.35□□□□□ -0.27
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PDCL-201ENST00000259467 NOS1P29475 1434 aa13.34□□□□□ -0.27
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PDCL-201ENST00000259467 PREX1Q8TCU6 1659 aa13.34□□□□□ -0.27
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PDCL-201ENST00000259467 C3P01024 1663 aa13.32□□□□□ -0.28
PDCL-201ENST00000259467 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
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PDCL-201ENST00000259467 ADAMTSL3P82987 1691 aa13.32□□□□□ -0.28
PDCL-201ENST00000259467 MROH2AA6NES4 1674 aa13.31□□□□□ -0.28
PDCL-201ENST00000259467 NLRP13Q86W25 1043 aa13.31□□□□□ -0.28
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PDCL-201ENST00000259467 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa13.28□□□□□ -0.28
PDCL-201ENST00000259467 PTPRMP28827 1452 aa13.28□□□□□ -0.28
PDCL-201ENST00000259467 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa13.27□□□□□ -0.28
PDCL-201ENST00000259467 SLC52A1Q9NWF4 448 aa13.27□□□□□ -0.28
PDCL-201ENST00000259467 PPLO60437 1756 aa13.27□□□□□ -0.28
PDCL-201ENST00000259467 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
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PDCL-201ENST00000259467 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
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PDCL-201ENST00000259467 PIK3C2BO00750 1634 aa13.26□□□□□ -0.29
PDCL-201ENST00000259467 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa13.25□□□□□ -0.29
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PDCL-201ENST00000259467 RIMS2Q9UQ26 1411 aa13.17□□□□□ -0.3
PDCL-201ENST00000259467 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa13.17□□□□□ -0.3
PDCL-201ENST00000259467 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
PDCL-201ENST00000259467 UBR1Q8IWV7 1749 aa13.16□□□□□ -0.3
PDCL-201ENST00000259467 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa13.16□□□□□ -0.3
PDCL-201ENST00000259467 SLC26A8Q96RN1 970 aa13.16□□□□□ -0.3
PDCL-201ENST00000259467 TMEM2Q9UHN6 1383 aa13.15□□□□□ -0.3
PDCL-201ENST00000259467 USP32Q8NFA0 1604 aa13.15□□□□□ -0.3
PDCL-201ENST00000259467 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
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