RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249501.4

HOXD10-201, Transcript of homeobox D10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD10, Length 1,989 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10-201ENST00000249501 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXD10-201ENST00000249501 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD10-201ENST00000249501 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXD10-201ENST00000249501 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXD10-201ENST00000249501 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXD10-201ENST00000249501 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
HOXD10-201ENST00000249501 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXD10-201ENST00000249501 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXD10-201ENST00000249501 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXD10-201ENST00000249501 ZMYM3Q14202 1370 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXD10-201ENST00000249501 IQGAP1P46940 1657 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD10-201ENST00000249501 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD10-201ENST00000249501 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD10-201ENST00000249501 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD10-201ENST00000249501 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
HOXD10-201ENST00000249501 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXD10-201ENST00000249501 PIK3C2GO75747 1445 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXD10-201ENST00000249501 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
HOXD10-201ENST00000249501 TESK2Q96S53 571 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXD10-201ENST00000249501 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXD10-201ENST00000249501 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXD10-201ENST00000249501 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXD10-201ENST00000249501 ANP32CO43423 234 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXD10-201ENST00000249501 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
HOXD10-201ENST00000249501 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXD10-201ENST00000249501 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXD10-201ENST00000249501 C3P01024 1663 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXD10-201ENST00000249501 TNRQ92752 1358 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXD10-201ENST00000249501 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXD10-201ENST00000249501 ZFYVE9O95405 1425 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXD10-201ENST00000249501 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
HOXD10-201ENST00000249501 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
HOXD10-201ENST00000249501 ADGRB1O14514 1584 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXD10-201ENST00000249501 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
HOXD10-201ENST00000249501 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXD10-201ENST00000249501 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
HOXD10-201ENST00000249501 TMF1P82094 1093 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXD10-201ENST00000249501 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXD10-201ENST00000249501 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXD10-201ENST00000249501 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXD10-201ENST00000249501 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXD10-201ENST00000249501 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXD10-201ENST00000249501 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXD10-201ENST00000249501 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
HOXD10-201ENST00000249501 CCER2I3L3R5 266 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD10-201ENST00000249501 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
HOXD10-201ENST00000249501 ALKQ9UM73 1620 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD10-201ENST00000249501 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
HOXD10-201ENST00000249501 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXD10-201ENST00000249501 NLRP1Q9C000 1473 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD10-201ENST00000249501 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
HOXD10-201ENST00000249501 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
HOXD10-201ENST00000249501 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD10-201ENST00000249501 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
HOXD10-201ENST00000249501 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
HOXD10-201ENST00000249501 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD10-201ENST00000249501 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.22■■□□□ 1.79
HOXD10-201ENST00000249501 STK26Q9P289 416 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD10-201ENST00000249501 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXD10-201ENST00000249501 PTPRMP28827 1452 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXD10-201ENST00000249501 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXD10-201ENST00000249501 CDCA8Q53HL2 280 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD10-201ENST00000249501 MYOM1P52179 1685 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXD10-201ENST00000249501 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
HOXD10-201ENST00000249501 PANK3Q9H999 370 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXD10-201ENST00000249501 SLC24A1O60721 1099 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXD10-201ENST00000249501 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
HOXD10-201ENST00000249501 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
HOXD10-201ENST00000249501 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
HOXD10-201ENST00000249501 CCDC184Q52MB2 194 aa26.14■■□□□ 1.77
HOXD10-201ENST00000249501 LTKP29376 864 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXD10-201ENST00000249501 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.13■■□□□ 1.77
HOXD10-201ENST00000249501 BCANQ96GW7 911 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD10-201ENST00000249501 SLIT1O75093 1534 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD10-201ENST00000249501 METP08581 1390 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD10-201ENST00000249501 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD10-201ENST00000249501 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD10-201ENST00000249501 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD10-201ENST00000249501 PRAM1Q96QH2 718 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD10-201ENST00000249501 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
HOXD10-201ENST00000249501 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
HOXD10-201ENST00000249501 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD10-201ENST00000249501 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
HOXD10-201ENST00000249501 POGKQ9P215 609 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD10-201ENST00000249501 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD10-201ENST00000249501 DLC1Q96QB1 1528 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD10-201ENST00000249501 EID1Q9Y6B2 187 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD10-201ENST00000249501 MRS2Q9HD23 443 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD10-201ENST00000249501 EVC2Q86UK5 1308 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD10-201ENST00000249501 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
HOXD10-201ENST00000249501 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
HOXD10-201ENST00000249501 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
HOXD10-201ENST00000249501 ABCC11Q96J66 1382 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXD10-201ENST00000249501 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
HOXD10-201ENST00000249501 KNDC1Q76NI1 1749 aa26■■□□□ 1.75
HOXD10-201ENST00000249501 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26■■□□□ 1.75
HOXD10-201ENST00000249501 RALBP1Q15311 655 aa26■■□□□ 1.75
HOXD10-201ENST00000249501 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26■■□□□ 1.75
HOXD10-201ENST00000249501 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
HOXD10-201ENST00000249501 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms