RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221138.8

PPP2CB-201, Transcript of protein phosphatase 2 catalytic subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP2CB, Length 2,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2CB-201ENST00000221138 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.33■■■■■ 4.21
PPP2CB-201ENST00000221138 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
PPP2CB-201ENST00000221138 MSH5O43196 834 aa41.3■■■■■ 4.2
PPP2CB-201ENST00000221138 NLRP13Q86W25 1043 aa41.29■■■■■ 4.2
PPP2CB-201ENST00000221138 CEP152O94986 1710 aa41.29■■■■■ 4.2
PPP2CB-201ENST00000221138 INSRP06213 1382 aa41.28■■■■■ 4.2
PPP2CB-201ENST00000221138 NBPF1Q3BBV0 1214 aa41.26■■■■■ 4.2
PPP2CB-201ENST00000221138 TET3O43151 1660 aa41.26■■■■■ 4.19
PPP2CB-201ENST00000221138 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
PPP2CB-201ENST00000221138 TESK2Q96S53 571 aa41.23■■■■■ 4.19
PPP2CB-201ENST00000221138 RGL3Q3MIN7 710 aa41.22■■■■■ 4.19
PPP2CB-201ENST00000221138 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.19■■■■■ 4.18
PPP2CB-201ENST00000221138 ABCC3O15438 1527 aa41.18■■■■■ 4.18
PPP2CB-201ENST00000221138 DISP3Q9P2K9 1392 aa41.18■■■■■ 4.18
PPP2CB-201ENST00000221138 MADDQ8WXG6 1647 aa41.17■■■■■ 4.18
PPP2CB-201ENST00000221138 MLECQ14165 292 aa41.17■■■■■ 4.18
PPP2CB-201ENST00000221138 IQGAP1P46940 1657 aa41.16■■■■■ 4.18
PPP2CB-201ENST00000221138 TRPM2O94759 1503 aa41.15■■■■■ 4.18
PPP2CB-201ENST00000221138 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa41.14■■■■■ 4.18
PPP2CB-201ENST00000221138 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
PPP2CB-201ENST00000221138 PDE3BQ13370 1112 aa41.13■■■■■ 4.17
PPP2CB-201ENST00000221138 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.12■■■■■ 4.17
PPP2CB-201ENST00000221138 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.1■■■■■ 4.17
PPP2CB-201ENST00000221138 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.1■■■■■ 4.17
PPP2CB-201ENST00000221138 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
PPP2CB-201ENST00000221138 TMF1P82094 1093 aa41.08■■■■■ 4.17
PPP2CB-201ENST00000221138 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.17
PPP2CB-201ENST00000221138 CCDC136Q96JN2 1154 aa41.07■■■■■ 4.17
PPP2CB-201ENST00000221138 PTPRTO14522 1441 aa41.05■■■■■ 4.16
PPP2CB-201ENST00000221138 STAC3Q96MF2 364 aa41.04■■■■■ 4.16
PPP2CB-201ENST00000221138 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.04■■■■■ 4.16
PPP2CB-201ENST00000221138 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.02■■■■■ 4.16
PPP2CB-201ENST00000221138 NPATQ14207 1427 aa41■■■■■ 4.15
PPP2CB-201ENST00000221138 RRP1P56182 461 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
PPP2CB-201ENST00000221138 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa40.97■■■■■ 4.15
PPP2CB-201ENST00000221138 CLTCL1P53675 1640 aa40.97■■■■■ 4.15
PPP2CB-201ENST00000221138 PANK3Q9H999 370 aa40.96■■■■■ 4.15
PPP2CB-201ENST00000221138 SYNMO15061 1565 aa40.94■■■■■ 4.15
PPP2CB-201ENST00000221138 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.94■■■■■ 4.14
PPP2CB-201ENST00000221138 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
PPP2CB-201ENST00000221138 RCAN3Q9UKA8 241 aa40.92■■■■■ 4.14
PPP2CB-201ENST00000221138 ERICH6Q7L0X2 663 aa40.9■■■■■ 4.14
PPP2CB-201ENST00000221138 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
PPP2CB-201ENST00000221138 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa40.87■■■■■ 4.13
PPP2CB-201ENST00000221138 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
PPP2CB-201ENST00000221138 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.85■■■■■ 4.13
PPP2CB-201ENST00000221138 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.82■■■■■ 4.13
PPP2CB-201ENST00000221138 MYOM1P52179 1685 aa40.81■■■■■ 4.12
PPP2CB-201ENST00000221138 ZMYM3Q14202 1370 aa40.8■■■■■ 4.12
PPP2CB-201ENST00000221138 CDCA8Q53HL2 280 aa40.8■■■■■ 4.12
PPP2CB-201ENST00000221138 MROH2AA6NES4 1674 aa40.8■■■■■ 4.12
PPP2CB-201ENST00000221138 NOS1P29475 1434 aa40.79■■■■■ 4.12
PPP2CB-201ENST00000221138 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
PPP2CB-201ENST00000221138 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.76■■■■■ 4.12
PPP2CB-201ENST00000221138 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
PPP2CB-201ENST00000221138 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa40.73■■■■■ 4.11
PPP2CB-201ENST00000221138 MYOM2P54296 1465 aa40.73■■■■■ 4.11
PPP2CB-201ENST00000221138 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
PPP2CB-201ENST00000221138 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa40.72■■■■■ 4.11
PPP2CB-201ENST00000221138 ERVK-7P63135 1459 aa40.72■■■■■ 4.11
PPP2CB-201ENST00000221138 EXOC6Q8TAG9 804 aa40.71■■■■■ 4.11
PPP2CB-201ENST00000221138 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.7■■■■■ 4.11
PPP2CB-201ENST00000221138 IFT172Q9UG01 1749 aa40.69■■■■■ 4.1
PPP2CB-201ENST00000221138 KIF1BO60333 1816 aa40.69■■■■■ 4.1
PPP2CB-201ENST00000221138 PIK3C2GO75747 1445 aa40.67■■■■■ 4.1
PPP2CB-201ENST00000221138 CDCA7LQ96GN5 454 aa40.67■■■■■ 4.1
PPP2CB-201ENST00000221138 KNSTRNQ9Y448 316 aa40.67■■■■■ 4.1
PPP2CB-201ENST00000221138 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
PPP2CB-201ENST00000221138 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
PPP2CB-201ENST00000221138 C3P01024 1663 aa40.66■■■■■ 4.1
PPP2CB-201ENST00000221138 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.66■■■■■ 4.1
PPP2CB-201ENST00000221138 PIK3C2BO00750 1634 aa40.65■■■■■ 4.1
PPP2CB-201ENST00000221138 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
PPP2CB-201ENST00000221138 PPP2R1AP30153 589 aa40.62■■■■■ 4.09
PPP2CB-201ENST00000221138 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
PPP2CB-201ENST00000221138 SLC24A1O60721 1099 aa40.61■■■■■ 4.09
PPP2CB-201ENST00000221138 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
PPP2CB-201ENST00000221138 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP40.59■■■■■ 4.09
PPP2CB-201ENST00000221138 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.59■■■■■ 4.09
PPP2CB-201ENST00000221138 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40.58■■■■■ 4.09
PPP2CB-201ENST00000221138 IDI1Q13907 227 aa40.57■■■■■ 4.09
PPP2CB-201ENST00000221138 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.08
PPP2CB-201ENST00000221138 ADAMTS8Q9UP79 889 aa40.55■■■■■ 4.08
PPP2CB-201ENST00000221138 NRXN1Q9ULB1 1477 aa40.54■■■■■ 4.08
PPP2CB-201ENST00000221138 PLPPR3Q6T4P5 718 aa40.52■■■■■ 4.08
PPP2CB-201ENST00000221138 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
PPP2CB-201ENST00000221138 MS4A1P11836 297 aa40.5■■■■■ 4.07
PPP2CB-201ENST00000221138 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP40.5■■■■■ 4.07
PPP2CB-201ENST00000221138 ADGRB3O60242 1522 aa40.49■■■■■ 4.07
PPP2CB-201ENST00000221138 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP40.49■■■■■ 4.07
PPP2CB-201ENST00000221138 ZNF521Q96K83 1311 aa40.49■■■■■ 4.07
PPP2CB-201ENST00000221138 TNRQ92752 1358 aa40.48■■■■■ 4.07
PPP2CB-201ENST00000221138 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.48■■■■■ 4.07
PPP2CB-201ENST00000221138 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa40.45■■■■■ 4.07
PPP2CB-201ENST00000221138 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa40.45■■■■■ 4.07
PPP2CB-201ENST00000221138 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa40.45■■■■■ 4.07
PPP2CB-201ENST00000221138 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.43■■■■■ 4.06
PPP2CB-201ENST00000221138 DUSP27Q5VZP5 1158 aa40.38■■■■■ 4.05
PPP2CB-201ENST00000221138 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
PPP2CB-201ENST00000221138 CRBNQ96SW2 442 aa40.36■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms