RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216420.11

CGRRF1-201, Transcript of cell growth regulator with ring finger domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CGRRF1, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1-201ENST00000216420 KIAA0556O60303 1618 aa23.56■■□□□ 1.36
CGRRF1-201ENST00000216420 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CGRRF1-201ENST00000216420 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CGRRF1-201ENST00000216420 AAMPQ13685 434 aa23.55■■□□□ 1.36
CGRRF1-201ENST00000216420 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CGRRF1-201ENST00000216420 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.54■■□□□ 1.36
CGRRF1-201ENST00000216420 PIK3C2GO75747 1445 aa23.54■■□□□ 1.36
CGRRF1-201ENST00000216420 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.36
CGRRF1-201ENST00000216420 PDCL3Q9H2J4 239 aa23.53■■□□□ 1.36
CGRRF1-201ENST00000216420 TRAK2O60296 914 aa23.52■■□□□ 1.36
CGRRF1-201ENST00000216420 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.52■■□□□ 1.36
CGRRF1-201ENST00000216420 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.52■■□□□ 1.36
CGRRF1-201ENST00000216420 GRPEL1Q9HAV7 217 aa23.52■■□□□ 1.35
CGRRF1-201ENST00000216420 PPP2R1AP30153 589 aa23.51■■□□□ 1.35
CGRRF1-201ENST00000216420 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.51■■□□□ 1.35
CGRRF1-201ENST00000216420 NUP160Q12769 1436 aa23.5■■□□□ 1.35
CGRRF1-201ENST00000216420 NGEFQ8N5V2 710 aa23.5■■□□□ 1.35
CGRRF1-201ENST00000216420 DISP1Q96F81 1524 aa23.49■■□□□ 1.35
CGRRF1-201ENST00000216420 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.48■■□□□ 1.35
CGRRF1-201ENST00000216420 ERBB4Q15303 1308 aa23.48■■□□□ 1.35
CGRRF1-201ENST00000216420 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CGRRF1-201ENST00000216420 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.48■■□□□ 1.35
CGRRF1-201ENST00000216420 TMF1P82094 1093 aa23.48■■□□□ 1.35
CGRRF1-201ENST00000216420 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.48■■□□□ 1.35
CGRRF1-201ENST00000216420 E9PSI1 815 aa23.47■■□□□ 1.35
CGRRF1-201ENST00000216420 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.47■■□□□ 1.35
CGRRF1-201ENST00000216420 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CGRRF1-201ENST00000216420 A2MP01023 1474 aa23.46■■□□□ 1.35
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.46■■□□□ 1.35
CGRRF1-201ENST00000216420 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.46■■□□□ 1.35
CGRRF1-201ENST00000216420 ARID3CA6NKF2 412 aa23.45■■□□□ 1.35
CGRRF1-201ENST00000216420 BCAR3O75815 825 aa23.45■■□□□ 1.35
CGRRF1-201ENST00000216420 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
CGRRF1-201ENST00000216420 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.45■■□□□ 1.35
CGRRF1-201ENST00000216420 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.45■■□□□ 1.34
CGRRF1-201ENST00000216420 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.45■■□□□ 1.34
CGRRF1-201ENST00000216420 SYNMO15061 1565 aa23.44■■□□□ 1.34
CGRRF1-201ENST00000216420 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.44■■□□□ 1.34
CGRRF1-201ENST00000216420 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.44■■□□□ 1.34
CGRRF1-201ENST00000216420 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.44■■□□□ 1.34
CGRRF1-201ENST00000216420 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CGRRF1-201ENST00000216420 SYNJ2O15056 1496 aa23.43■■□□□ 1.34
CGRRF1-201ENST00000216420 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.43■■□□□ 1.34
CGRRF1-201ENST00000216420 TERF1P54274 439 aa23.42■■□□□ 1.34
CGRRF1-201ENST00000216420 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.41■■□□□ 1.34
CGRRF1-201ENST00000216420 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CGRRF1-201ENST00000216420 ARXQ96QS3 562 aa23.4■■□□□ 1.34
CGRRF1-201ENST00000216420 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CGRRF1-201ENST00000216420 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.4■■□□□ 1.34
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
CGRRF1-201ENST00000216420 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CGRRF1-201ENST00000216420 DDIT3P35638 169 aa23.37■■□□□ 1.33
CGRRF1-201ENST00000216420 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.37■■□□□ 1.33
CGRRF1-201ENST00000216420 PTMSP20962 102 aa23.35■■□□□ 1.33
CGRRF1-201ENST00000216420 IQGAP1P46940 1657 aa23.35■■□□□ 1.33
CGRRF1-201ENST00000216420 PLA2R1Q13018 1463 aa23.34■■□□□ 1.33
CGRRF1-201ENST00000216420 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.33■■□□□ 1.33
CGRRF1-201ENST00000216420 COG6Q9Y2V7 657 aa23.33■■□□□ 1.33
CGRRF1-201ENST00000216420 UNC13BO14795 1591 aa23.33■■□□□ 1.33
CGRRF1-201ENST00000216420 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CGRRF1-201ENST00000216420 PPP1R9BQ96SB3 815 aa23.32■■□□□ 1.32
CGRRF1-201ENST00000216420 MAP7D2Q96T17 732 aa23.32■■□□□ 1.32
CGRRF1-201ENST00000216420 SHROOM2Q13796 1616 aa23.32■■□□□ 1.32
CGRRF1-201ENST00000216420 PRDM4Q9UKN5 801 aa23.31■■□□□ 1.32
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CGRRF1-201ENST00000216420 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CGRRF1-201ENST00000216420 MYOM1P52179 1685 aa23.31■■□□□ 1.32
CGRRF1-201ENST00000216420 APAF1O14727 1248 aa23.31■■□□□ 1.32
CGRRF1-201ENST00000216420 OFD1O75665 1012 aa23.31■■□□□ 1.32
CGRRF1-201ENST00000216420 PANK1Q8TE04 598 aa23.31■■□□□ 1.32
CGRRF1-201ENST00000216420 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.31■■□□□ 1.32
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC173Q0VFZ6 552 aa23.3■■□□□ 1.32
CGRRF1-201ENST00000216420 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa23.3■■□□□ 1.32
CGRRF1-201ENST00000216420 ATP10AO60312 1499 aa23.29■■□□□ 1.32
CGRRF1-201ENST00000216420 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.29■■□□□ 1.32
CGRRF1-201ENST00000216420 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CGRRF1-201ENST00000216420 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.28■■□□□ 1.32
CGRRF1-201ENST00000216420 ZSCAN30Q86W11 494 aa23.27■■□□□ 1.32
CGRRF1-201ENST00000216420 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.27■■□□□ 1.32
CGRRF1-201ENST00000216420 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CGRRF1-201ENST00000216420 HSCBQ8IWL3 235 aa23.26■■□□□ 1.31
CGRRF1-201ENST00000216420 SNX21Q969T3 373 aa23.26■■□□□ 1.31
CGRRF1-201ENST00000216420 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CGRRF1-201ENST00000216420 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CGRRF1-201ENST00000216420 CDCA8Q53HL2 280 aa23.26■■□□□ 1.31
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.26■■□□□ 1.31
CGRRF1-201ENST00000216420 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.26■■□□□ 1.31
CGRRF1-201ENST00000216420 TSPY4P0CV99 314 aa23.25■■□□□ 1.31
CGRRF1-201ENST00000216420 TSPY10P0CW01 314 aa23.25■■□□□ 1.31
CGRRF1-201ENST00000216420 SMC5Q8IY18 1101 aa23.24■■□□□ 1.31
CGRRF1-201ENST00000216420 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.24■■□□□ 1.31
CGRRF1-201ENST00000216420 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.24■■□□□ 1.31
CGRRF1-201ENST00000216420 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.24■■□□□ 1.31
CGRRF1-201ENST00000216420 GBP4Q96PP9 640 aa23.23■■□□□ 1.31
CGRRF1-201ENST00000216420 GRIN2AQ12879 1464 aa23.23■■□□□ 1.31
CGRRF1-201ENST00000216420 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CGRRF1-201ENST00000216420 RIPK4P57078 832 aa23.21■■□□□ 1.31
CGRRF1-201ENST00000216420 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.21■■□□□ 1.31
CGRRF1-201ENST00000216420 HS1BP3Q53T59 392 aa23.21■■□□□ 1.31
CGRRF1-201ENST00000216420 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms