RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216268.5

ZBED4-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED4, Length 6,893 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED4-201ENST00000216268 STK11IPQ8N1F8 1099 aa13.86□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 CDR1P51861 262 aa13.86□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 TIGD1Q96MW7 591 aa13.85□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 TRHP20396 242 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 GOLGA2Q08379 1002 aa13.85□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 DCTN1Q14203 1278 aa13.85□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 HMMRO75330 724 aa13.83□□□□□ -0.19
ZBED4-201ENST00000216268 PRXQ9BXM0 1461 aa13.83□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 TSPY26PQ9H489 355 aa13.83□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 DYNC1I1O14576 645 aa13.83□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 PRDM2Q13029 1718 aa13.83□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 KIAA0754O94854 1291 aa13.83□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 CCDC112Q8NEF3 446 aa13.82□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 DNMBPQ6XZF7 1577 aa13.82□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 NEFHP12036 1026 aa13.81□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 TPM1P09493 284 aa13.81□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 CLCN1P35523 988 aa13.81□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 RNF20Q5VTR2 975 aa13.81□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 BACH2Q9BYV9 841 aa13.81□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 TMF1P82094 1093 aa13.8□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 PLCD3Q8N3E9 789 aa13.8□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa13.8□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 GGT6Q6P531 493 aa13.79□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 PLCD4Q9BRC7 762 aa13.79□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 PTPRGP23470 1445 aa13.79□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 GRIN2BQ13224 1484 aa13.79□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 CCP110O43303 1012 aa13.79□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 MBD3O95983 291 aa13.79□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 CGNL1Q0VF96 1302 aa13.79□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 C22orf23Q9BZE7 217 aa13.79□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 PLIN1O60240 522 aa13.78□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 RNF214Q8ND24 703 aa13.78□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 NBPF1Q3BBV0 1214 aa13.78□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa13.77□□□□□ -0.2
ZBED4-201ENST00000216268 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa13.77□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 PKD2Q13563 968 aa13.77□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 OSCARQ8IYS5 282 aa13.76□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 DYDC1Q8WWB3 177 aa13.76□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 APBB1O00213 710 aa13.76□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 NLRP13Q86W25 1043 aa13.75□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 DCAF11Q8TEB1 546 aa13.74□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 MCM4P33991 863 aa13.74□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 RSPH4AQ5TD94 716 aa13.74□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 MPHOSPH9Q99550 1183 aa13.74□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 POGKQ9P215 609 aa13.73□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 FAM107BQ9H098 131 aa13.73□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 TNNT1P13805 278 aa13.73□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 DDX11Q96FC9 970 aa13.73□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 CTR9Q6PD62 1173 aa13.73□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 INCENPQ9NQS7 918 aa13.73□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 SSR1P43307 286 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 KIF15Q9NS87 1388 aa13.72□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 PES1O00541 588 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 TRERF1Q96PN7 1200 aa13.72□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 SMC4Q9NTJ3 1288 aa13.72□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa13.72□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 GORABQ5T7V8 394 aa13.72□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 CLGNO14967 610 aa13.71□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 IFT140Q96RY7 1462 aa13.71□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 H3BQV1 296 aa13.71□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 ERLIN1O75477 346 aa13.71□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 MCM5P33992 734 aa13.71□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 IFFO2Q5TF58 517 aa13.71□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 ERICH3Q5RHP9 1530 aa13.71□□□□□ -0.21
ZBED4-201ENST00000216268 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa13.71□□□□□ -0.22
ZBED4-201ENST00000216268 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
ZBED4-201ENST00000216268 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
ZBED4-201ENST00000216268 NPHP1O15259 732 aa13.7□□□□□ -0.22
ZBED4-201ENST00000216268 LMOD3Q0VAK6 560 aa13.7□□□□□ -0.22
ZBED4-201ENST00000216268 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa13.7□□□□□ -0.22
ZBED4-201ENST00000216268 TRIM5Q9C035 493 aa13.7□□□□□ -0.22
ZBED4-201ENST00000216268 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
ZBED4-201ENST00000216268 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
ZBED4-201ENST00000216268 NUP155O75694 1391 aa13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms