RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007722.11

ITGA3-201, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ITGA3, Length 3,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-201ENST00000007722 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa16.62■□□□□ 0.25
ITGA3-201ENST00000007722 C22orf23Q9BZE7 217 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-201ENST00000007722 WDR62O43379 1518 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-201ENST00000007722 RBM10P98175 930 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-201ENST00000007722 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-201ENST00000007722 IQGAP2Q13576 1575 aa16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-201ENST00000007722 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-201ENST00000007722 FSD2A1L4K1 749 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-201ENST00000007722 PLEKHD1A6NEE1 506 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-201ENST00000007722 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-201ENST00000007722 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-201ENST00000007722 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
ITGA3-201ENST00000007722 ERBB4Q15303 1308 aa16.58■□□□□ 0.25
ITGA3-201ENST00000007722 PDE3AQ14432 1141 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-201ENST00000007722 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-201ENST00000007722 DDX11L8A8MPP1 907 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-201ENST00000007722 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF521Q96K83 1311 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-201ENST00000007722 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16.56■□□□□ 0.24
ITGA3-201ENST00000007722 PRAG1Q86YV5 1406 aa16.56■□□□□ 0.24
ITGA3-201ENST00000007722 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa16.56■□□□□ 0.24
ITGA3-201ENST00000007722 NCLP19338 710 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
ITGA3-201ENST00000007722 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa16.56■□□□□ 0.24
ITGA3-201ENST00000007722 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
ITGA3-201ENST00000007722 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.55■□□□□ 0.24
ITGA3-201ENST00000007722 E9PCH4 1651 aa16.54■□□□□ 0.24
ITGA3-201ENST00000007722 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
ITGA3-201ENST00000007722 RLBP1P12271 317 aa16.54■□□□□ 0.24
ITGA3-201ENST00000007722 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
ITGA3-201ENST00000007722 ZBTB7CA1YPR0 619 aa16.54■□□□□ 0.24
ITGA3-201ENST00000007722 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
ITGA3-201ENST00000007722 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-201ENST00000007722 FAM13BQ9NYF5 915 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-201ENST00000007722 MSNP26038 577 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-201ENST00000007722 GBP4Q96PP9 640 aa16.51■□□□□ 0.23
ITGA3-201ENST00000007722 CDCA8Q53HL2 280 aa16.51■□□□□ 0.23
ITGA3-201ENST00000007722 ERCC6Q03468 1493 aa16.51■□□□□ 0.23
ITGA3-201ENST00000007722 GAS2L3Q86XJ1 694 aa16.5■□□□□ 0.23
ITGA3-201ENST00000007722 WWC1Q8IX03 1113 aa16.5■□□□□ 0.23
ITGA3-201ENST00000007722 TPM2P07951 284 aa16.5■□□□□ 0.23
ITGA3-201ENST00000007722 INSRP06213 1382 aa16.49■□□□□ 0.23
ITGA3-201ENST00000007722 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
ITGA3-201ENST00000007722 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
ITGA3-201ENST00000007722 RARSP54136 660 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-201ENST00000007722 ITPRIPQ8IWB1 547 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-201ENST00000007722 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-201ENST00000007722 MAGI2Q86UL8 1455 aa16.47■□□□□ 0.23
ITGA3-201ENST00000007722 ADGBQ8N7X0 1667 aa16.47■□□□□ 0.23
ITGA3-201ENST00000007722 NASPP49321 788 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
ITGA3-201ENST00000007722 PLB1Q6P1J6 1458 aa16.46■□□□□ 0.23
ITGA3-201ENST00000007722 PDCL3Q9H2J4 239 aa16.46■□□□□ 0.23
ITGA3-201ENST00000007722 ADGRL2O95490 1459 aa16.46■□□□□ 0.22
ITGA3-201ENST00000007722 PODXL2Q9NZ53 605 aa16.46■□□□□ 0.22
ITGA3-201ENST00000007722 GOLGA6L22H0YM25 854 aa16.45■□□□□ 0.22
ITGA3-201ENST00000007722 NLRP1Q9C000 1473 aa16.45■□□□□ 0.22
ITGA3-201ENST00000007722 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
ITGA3-201ENST00000007722 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
ITGA3-201ENST00000007722 TCP11L2Q8N4U5 519 aa16.44■□□□□ 0.22
ITGA3-201ENST00000007722 A2MP01023 1474 aa16.43■□□□□ 0.22
ITGA3-201ENST00000007722 LNPKQ9C0E8 428 aa16.43■□□□□ 0.22
ITGA3-201ENST00000007722 SMC4Q9NTJ3 1288 aa16.43■□□□□ 0.22
ITGA3-201ENST00000007722 KDM5DQ9BY66 1539 aa16.43■□□□□ 0.22
ITGA3-201ENST00000007722 MORC1Q86VD1 984 aa16.43■□□□□ 0.22
ITGA3-201ENST00000007722 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-201ENST00000007722 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-201ENST00000007722 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-201ENST00000007722 CEP170Q5SW79 1584 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-201ENST00000007722 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-201ENST00000007722 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-201ENST00000007722 MVPQ14764 893 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-201ENST00000007722 ZSCAN30Q86W11 494 aa16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-201ENST00000007722 NINLQ9Y2I6 1382 aa16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-201ENST00000007722 CCDC173Q0VFZ6 552 aa16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-201ENST00000007722 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-201ENST00000007722 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-201ENST00000007722 ITSN2Q9NZM3 1697 aa16.39■□□□□ 0.22
ITGA3-201ENST00000007722 FAM135AQ9P2D6 1515 aa16.39■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 GPRASP1Q5JY77 1395 aa16.39■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 SSFA2P28290 1259 aa16.39■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 PRDM10Q9NQV6 1147 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 RUNDC1Q96C34 613 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 WDR7Q9Y4E6 1490 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 MCTP1Q6DN14 999 aa16.36■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 DISP1Q96F81 1524 aa16.36■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 PLEKHG5O94827 1062 aa16.35■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 PIK3C2GO75747 1445 aa16.35■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 KIAA0556O60303 1618 aa16.35■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 UQCRHLA0A096LP55 91 aa16.34■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 UQCRHP07919 91 aa16.34■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms