RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W YRF1-2P40105 1681 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W CAR1P00812 333 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W MSW1P04803 379 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W RAD6P06104 172 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W AMD1P15274 810 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W ERD1P16151 362 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W BET2P20133 325 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W SYN8P31377 255 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W ACB1P31787 87 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W MUD1P32605 298 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W SNC2P33328 115 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data3.03□□□□□ -1.92not detected
VFA1YER128W SDH4P37298 181 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YBL029WP38201 376 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YBR096WP38256 230 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W VBA2P38358 474 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W RPS20P38701 121 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W BAT1P38891 393 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YER076CP40049 302 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W BTT1P40314 149 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YIL152WP40455 235 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W VMA21P41806 77 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YJR015WP47090 510 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YIP1P53039 248 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W NIF3P53081 288 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W THG1P53215 237 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W CLD1P53264 445 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W FRE4P53746 719 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W LSM7P53905 115 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W RSM10Q03201 203 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W THI74Q04083 370 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W TSA2Q04120 196 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W SCW10Q04951 389 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W PIN3Q06449 215 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W GPI11Q06636 219 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W ENT4Q07872 247 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W PAU23Q07987 124 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W HNT3Q08702 217 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W PAU17Q12370 124 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W RAX2Q12465 1220 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W ISD11Q6Q560 94 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W UBA3Q99344 299 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YBT1P32386 1661 aa3.03□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YRF1-3P0CX14 1859 aa3.03□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YRF1-7P0CX15 1859 aa3.03□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YRF1-6P53819 1859 aa3.03□□□□□ -1.93
VFA1YER128W SEC7P11075 2009 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W COX3P00420 269 aa3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W MES1P00958 751 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W RPS19AP07280 144 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W RPS19BP07281 144 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YER039C-AP0CD97 72 aa3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YML003WP0CF16 290 aa3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W INO4P13902 151 aa3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W PHO85P17157 305 aa3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W GLN3P18494 730 aa3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W CLB6P32943 380 aa3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W TKL2P33315 681 aa3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W ZRT3P34240 503 aa3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YHL049CP38722 271 aa3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W GAA1P39012 614 aa3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W SPC25P40014 221 aa3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W MOB2P43563 287 aa3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YGR015CP53208 328 aa3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W ERV29P53337 310 aa3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W AAH1P53909 347 aa3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W CRZ1P53968 678 aa3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W ECM9Q02202 377 aa3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W HRI1Q05905 244 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W DIC1Q06143 298 aa3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W SWC7Q06707 132 aa3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W STP4Q07351 490 aa3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W LDS2Q08218 356 aa3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W MCP1Q12106 302 aa3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W ORT1Q12375 292 aa3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YRF1-1P0CX20 1796 aa3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YRF1-5P0CX21 1796 aa3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YRF1-8P0CX22 1796 aa3.02□□□□□ -1.93
VFA1YER128W STE7P06784 515 aa3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YKR104WP0CE69 306 aa3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W RPB8P20436 146 aa3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W CKS1P20486 150 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W GPI12P23797 304 aa3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W TIP1P27654 210 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W GAC1P28006 793 aa3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W TOA2P32774 122 aa3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YBR090CP38253 122 aa3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YGP1P38616 354 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YHL026CP38740 315 aa3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W PRE5P40302 234 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W FLX1P40464 311 aa3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W ATG18P43601 500 aa3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W OST3P48439 350 aa3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YDL186WP48568 277 aa3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W SAY1P53324 424 aa3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W FMP41P53889 259 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
VFA1YER128W YNL095CP53932 642 aa3.01□□□□□ -1.93
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