RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	LZTR1	Q8N653	840 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM168A	Q92567	244 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKS1A	Q92625	1134 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	BRD9	Q9H8M2	597 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	DACT1	Q9NYF0	836 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	5.68	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	LRFN1	Q9P244	771 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	JAG2	Q9Y219	1238 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1W2PPC4	97 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	LGALS16	A8MUM7	142 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	IRAK2	O43187	625 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	IL18RAP	O95256	599 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	FUCA1	P04066	466 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	TACR1	P25103	407 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	ARL4A	P40617	200 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	JAG1	P78504	1218 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	FOXO1	Q12778	655 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	GRM1	Q13255	1194 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	DAG1	Q14118	895 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	PTPN18	Q99952	460 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	STK33	Q9BYT3	514 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	BTG4	Q9NY30	223 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	ITSN1	Q15811	1721 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	USP19	O94966	1318 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	USP32	Q8NFA0	1604 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1W2PQJ5	194 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	PRSS38	A1L453	326 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	NPC1	O15118	1278 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	INMT	O95050	263 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	NR1H2	P55055	460 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	BCAR1	P56945	870 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	DCAF7	P61962	342 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	DSC2	Q02487	901 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	EPHA7	Q15375	998 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	CCNG2	Q16589	344 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	CEP68	Q76N32	757 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	SESTD1	Q86VW0	696 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	NLRP10	Q86W26	655 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	IL31RA	Q8NI17	732 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	HVCN1	Q96D96	273 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	RAX2	Q96IS3	184 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	ARMT1	Q9H993	441 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	PANK3	Q9H999	370 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	STAP2	Q9UGK3	403 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	DPP7	Q9UHL4	492 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	ACE	P12821	1306 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	KIF1A	Q12756	1690 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	SSH2	Q76I76	1423 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	FSD2	A1L4K1	749 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	C22orf46	C9J442	243 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	SYT5	O00445	386 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5

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