RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627490.2

PBX1-222, Transcript of PBX homeobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PBX1, Length 1,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1-222ENST00000627490 FAM110CQ1W6H9 321 aa21.5■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa21.5■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 PIGWQ7Z7B1 504 aa21.5■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 SELENOSQ9BQE4 189 aa21.5■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 OSBPL7Q9BZF2 842 aa21.5■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 KIAA1586Q9HCI6 787 aa21.5■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 TLDC2A0PJX2 215 aa21.49■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 MAFGO15525 162 aa21.49■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 PEX10O60683 326 aa21.49■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 NPTX2P47972 431 aa21.49■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 PPP1R7Q15435 360 aa21.49■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 ARHGEF16Q5VV41 709 aa21.49■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 ANKRD35Q8N283 1001 aa21.49■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 CCT6BQ92526 530 aa21.49■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 YY1AP1Q9H869 796 aa21.49■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 KMT5AQ9NQR1 393 aa21.49■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 KLC4Q9NSK0 619 aa21.49■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 GOLGA8IPA6NC78 632 aa21.48■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 CCT8L1PA6NM43 557 aa21.48■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 GOLGA8JA6NMD2 632 aa21.48■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 ANKRD63C9JTQ0 380 aa21.48■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 STAM2O75886 525 aa21.48■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 MNAT1P51948 309 aa21.48■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 CENPCQ03188 943 aa21.48■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 AUHQ13825 339 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 PTK6Q13882 451 aa21.48■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 CEP128Q6ZU80 1094 aa21.48■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 IFNL1Q8IU54 200 aa21.48■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 MDM1Q8TC05 714 aa21.48■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa21.48■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 SLC40A1Q9NP59 571 aa21.48■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa21.48■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 DENND3A2RUS2 1198 aa21.48■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 TCEA3O75764 348 aa21.48■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 MAPK4P31152 587 aa21.48■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 TM4SF4P48230 202 aa21.48■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 UGCGQ16739 394 aa21.48■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 SGO2Q562F6 1265 aa21.48■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 GPD1LQ8N335 351 aa21.48■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 BBOF1Q8ND07 529 aa21.48■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa21.48■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 PLXNB2O15031 1838 aa21.47■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 CHUKO15111 745 aa21.47■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 GAS8O95995 478 aa21.47■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 CCND2P30279 289 aa21.47■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 XRCC4Q13426 336 aa21.47■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 RHBDF2Q6PJF5 856 aa21.47■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 TRIM72Q6ZMU5 477 aa21.47■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 VSIG10LQ86VR7 867 aa21.47■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 ABRAQ8N0Z2 381 aa21.47■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 MCPH1Q8NEM0 835 aa21.47■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 MAGEC3Q8TD91 643 aa21.47■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 KCNN1Q92952 543 aa21.47■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 GPRASP2Q96D09 838 aa21.47■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 SNF8Q96H20 258 aa21.47■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.47■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 CREBZFQ9NS37 354 aa21.47■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 SAMD15Q9P1V8 674 aa21.47■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 ZNF236Q9UL36 1845 aa21.47■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 LRRC37A2A6NM11 1700 aa21.47■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa21.46■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa21.46■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 UNGP13051 313 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 SCTRP47872 440 aa21.46■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 MCOLN2Q8IZK6 566 aa21.46■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 TAS1R2Q8TE23 839 aa21.46■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 CCDC127Q96BQ5 260 aa21.46■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 FOXP3Q9BZS1 431 aa21.46■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa21.46■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 NR3C2P08235 984 aa21.46■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 KRT17Q04695 432 aa21.46■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 CNGA2Q16280 664 aa21.46■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 SV2AQ7L0J3 742 aa21.46■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 ATP6V0A1Q93050 837 aa21.46■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 SAAL1Q96ER3 474 aa21.46■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 C1orf112Q9NSG2 853 aa21.46■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa21.46■■□□□ 1.03
PBX1-222ENST00000627490 DNM1LO00429 736 aa21.45■■□□□ 1.02
PBX1-222ENST00000627490 CCNE2O96020 404 aa21.45■■□□□ 1.02
PBX1-222ENST00000627490 FGFR4P22455 802 aa21.45■■□□□ 1.02
PBX1-222ENST00000627490 EDNRBP24530 442 aa21.45■■□□□ 1.02
PBX1-222ENST00000627490 APLP1P51693 650 aa21.45■■□□□ 1.02
PBX1-222ENST00000627490 CLDN10P78369 228 aa21.45■■□□□ 1.02
PBX1-222ENST00000627490 KCTD2Q14681 263 aa21.45■■□□□ 1.02
PBX1-222ENST00000627490 SMYD5Q6GMV2 418 aa21.45■■□□□ 1.02
PBX1-222ENST00000627490 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa21.45■■□□□ 1.02
PBX1-222ENST00000627490 CCDC91Q7Z6B0 441 aa21.45■■□□□ 1.02
PBX1-222ENST00000627490 RPAINQ86UA6 219 aa21.45■■□□□ 1.02
PBX1-222ENST00000627490 NLRX1Q86UT6 975 aa21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.8 ms