RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	TTC16	Q8NEE8	873 aa		7.76	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	CAGE1	Q8TC20	777 aa		7.76	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		7.76	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	AK8	Q96MA6	479 aa		7.76	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	SH3GL2	Q99962	352 aa		7.76	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	CDC23	Q9UJX2	597 aa		7.76	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		7.76	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP6R2	O75170	966 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	STBD1	O95210	358 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	ACTN1	P12814	892 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	VSNL1	P62760	191 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	TDH	Q8IZJ6	230 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	RDM1	Q8NG50	284 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	EXOC1	Q9NV70	894 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495		A6NHS1	94 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	ABLIM1	O14639	778 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	CREB3	O43889	395 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	E2F6	O75461	281 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	STIM1	Q13586	685 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	BLMH	Q13867	455 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	TFDP1	Q14186	410 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	E2F5	Q15329	346 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	DAW1	Q8N136	415 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	WDR24	Q96S15	920 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	GAD1	Q99259	594 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	NAT1	P18440	290 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	MLH1	P40692	756 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC12A3	P55017	1021 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	GPNMB	Q14956	572 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM192	Q8IY95	271 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	NEK9	Q8TD19	979 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	PAGE5	Q96GU1	130 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	IL23A	Q9NPF7	189 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	SNTG2	Q9NY99	539 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	REV3L	O60673	3130 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	GPR182	O15218	404 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP6V1G1	O75348	118 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	GPR32	O75388	356 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	EDN1	P05305	212 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	CMA1	P23946	247 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	RFC5	P40937	340 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	GUCY2F	P51841	1108 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	GIT2	Q14161	759 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	RESP18	Q5W5W9	173 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	KANK3	Q6NY19	840 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	COG1	Q8WTW3	980 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	P3H4	Q92791	437 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	B3GALT6	Q96L58	329 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	APOL5	Q9BWW9	433 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIM9	Q9C026	710 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM165	Q9HC07	324 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
LETMD1-238	ENST00000623495	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17

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