RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 PALB2Q86YC2 1186 aa27.01■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 BEST2Q8NFU1 509 aa27.01■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 MTRRQ9UBK8 725 aa27.01■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 PAPLNO95428 1278 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 MTHFRP42898 656 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 ARMCX5Q6P1M9 558 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 GLYCTKQ8IVS8 523 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 BRSK2Q8IWQ3 736 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 SCFD1Q8WVM8 642 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 RIPOR3Q96MK2 946 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 FAM213AQ9BRX8 229 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 BACE2Q9Y5Z0 518 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 EXTL3O43909 919 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 MCM4P33991 863 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP27■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 BMT2Q1RMZ1 405 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 NT5DC4Q86YG4 428 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 SAAL1Q96ER3 474 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa27■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 DOCK6Q96HP0 2047 aa26.99■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 MYO10Q9HD67 2058 aa26.99■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 SPDYE4A6NLX3 237 aa26.99■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 LOC730098B7Z3J9 87 aa26.99■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 GUCY2FP51841 1108 aa26.99■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 ATAT1Q5SQI0 421 aa26.99■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 TMC5Q6UXY8 1006 aa26.99■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 GPR149Q86SP6 731 aa26.99■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 TMEM130Q8N3G9 435 aa26.99■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 SLC39A2Q9NP94 309 aa26.99■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 CDH22Q9UJ99 828 aa26.99■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 M0QZQ0 153 aa26.98■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 PAX3P23760 479 aa26.98■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 PSMD2Q13200 908 aa26.98■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 RAB33AQ14088 237 aa26.98■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 KANK3Q6NY19 840 aa26.98■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 CYP26C1Q6V0L0 522 aa26.98■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 GPD1LQ8N335 351 aa26.98■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 KREMEN2Q8NCW0 462 aa26.98■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 FBXW11Q9UKB1 542 aa26.98■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 ANO9A1A5B4 782 aa26.97■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 ADAM12O43184 909 aa26.97■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 TGFB1I1O43294 461 aa26.97■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 ZNF202O95125 648 aa26.97■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 C9orf57Q5W0N0 161 aa26.97■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 KRBA2Q6ZNG9 492 aa26.97■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 EFCAB13Q8IY85 973 aa26.97■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 PCIF1Q9H4Z3 704 aa26.97■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 POMKQ9H5K3 350 aa26.97■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 EXOC1Q9NV70 894 aa26.97■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
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PMS1-220ENST00000618056 PIRO00625 290 aa26.96■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 TBC1D4O60343 1298 aa26.96■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 SPATA31D3P0C874 917 aa26.96■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 OR1D2P34982 312 aa26.96■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 KMT5BQ4FZB7 885 aa26.96■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 SLC8B1Q6J4K2 584 aa26.96■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa26.96■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 APPL2Q8NEU8 664 aa26.96■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa26.96■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa26.96■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 CDY1Q9Y6F8 540 aa26.96■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 GOLGA8IPA6NC78 632 aa26.95■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 GOLGA8JA6NMD2 632 aa26.95■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 H7C4K7 107 aa26.95■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 WEE2P0C1S8 567 aa26.95■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 WNT7BP56706 349 aa26.95■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 LILRA4P59901 499 aa26.95■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 STK4Q13043 487 aa26.95■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 FEZF2Q8TBJ5 459 aa26.95■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 DPP3Q9NY33 737 aa26.95■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 HSPBP1Q9NZL4 362 aa26.95■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 TSC2P49815 1807 aa26.95■■□□□ 1.91
PMS1-220ENST00000618056 DOCK8Q8NF50 2099 aa26.94■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 PPEF2O14830 753 aa26.94■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 HS2ST1Q7LGA3 356 aa26.94■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 NELFCDQ8IXH7 590 aa26.94■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 KIAA0895Q8NCT3 520 aa26.94■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP26.94■■□□□ 1.98e-10■■□□□ 12.3
PMS1-220ENST00000618056 KIAA1586Q9HCI6 787 aa26.94■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 RFPL2O75678 378 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 ZMYND10O75800 440 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 DPYDQ12882 1025 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 C12orf56Q8IXR9 622 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-220ENST00000618056 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
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