RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 MLXIPLQ9NP71 852 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SERPINB9P50453 376 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 KDSRQ06136 332 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 NCAPHQ15003 741 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PPP1R18Q6NYC8 613 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 FRMD5Q7Z6J6 570 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CYP4Z1Q86W10 505 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 VCPKMTQ9H867 229 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 HDAC6Q9UBN7 1215 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ABCA8O94911 1581 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 NDUFAF6Q330K2 333 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CYP4A22Q5TCH4 519 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM35BQ8NCS4 154 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD49Q8WVL7 239 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 DNAJC7Q99615 494 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 NOD2Q9HC29 1040 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 MYL4P12829 197 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 UQCRBP14927 111 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF18P17022 549 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SERPINB8P50452 374 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 AP3M2P53677 418 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC41Q15345 812 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PPM1NQ8N819 430 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SH3KBP1Q96B97 665 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 WDR24Q96S15 920 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 VPS11Q9H270 941 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 H0YIN7 160 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PDE5AO76074 875 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ALAS1P13196 640 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PIK3R1P27986 724 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 RPS8P62241 208 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CDC42EP1Q00587 391 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 GSTA3Q16772 222 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TMC4Q7Z404 712 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 AKT3Q9Y243 479 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 MYH7BA7E2Y1 1941 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 MEI4A8MW99 385 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ASNA1O43681 348 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 DLGAP3O95886 979 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 IFNA14P01570 189 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PAX3P23760 479 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 MAPK1P28482 360 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 KCNH2Q12809 1159 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ZCWPW2Q504Y3 356 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 MCRS1Q96EZ8 462 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ASXL2Q76L83 1435 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ANO4Q32M45 955 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 INPP5DQ92835 1189 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 RIC8BQ9NVN3 520 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ALDH1A2O94788 518 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PDE8BO95263 885 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PRCPP42785 496 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ARID5BQ14865 1188 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 FAM47CQ5HY64 1035 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 FAM83BQ5T0W9 1011 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 IZUMO3Q5VZ72 239 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 EGFL8Q99944 293 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SERHL2Q9H4I8 314 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SERHLQ9NQF3 203 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 AKAP10O43572 662 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SNX4O95219 450 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 DLGAP5Q15398 846 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TSNQ15631 228 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ANKS6Q68DC2 871 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM65Q6PJ69 517 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CCNYL1Q8N7R7 359 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 EXT2Q93063 718 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SERPINB12Q96P63 405 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CYTH3O43739 400 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PRMT3O60678 531 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 YY1P25490 414 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 KRT17Q04695 432 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 GTF2H3Q13889 308 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 VPS33BQ9H267 617 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SPDYE5A6NIY4 337 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 NEMP1O14524 444 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 APOL1O14791 398 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 FYNP06241 537 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 KCNB1Q14721 858 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SPDYE7PQ495Y7 208 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC157Q569K6 752 aa7.3□□□□□ -1.24
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