RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592790.1

VMP1-216, Transcript of vacuole membrane protein 1, human

Gene VMP1, Length 4,325 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VMP1-216	ENST00000592790	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	MX2	P20592	715 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ATP6V1C1	P21283	382 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	KCNA3	P22001	575 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	CCND2	P30279	289 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	CIITA	P33076	1130 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	STAT3	P40763	770 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	TMPRSS15	P98073	1019 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	MED21	Q13503	144 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	RCN2	Q14257	317 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	HIC1	Q14526	733 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	P3H1	Q32P28	736 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	KAZN	Q674X7	775 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ERICH1	Q86X53	443 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	RFX6	Q8HWS3	928 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	SP8	Q8IXZ3	490 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	TEKT4	Q8WW24	435 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	SEC14L1	Q92503	715 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	SLCO2A1	Q92959	643 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	GMCL1	Q96IK5	515 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	KCNK16	Q96T55	309 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790		F5H6K3	240 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790		H7C0C1	242 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	PIK3CD	O00329	1044 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	EPHB6	O15197	1021 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	PFDN1	O60925	122 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	NOL4	O94818	638 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	TOMM70	O94826	608 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	CYP1A2	P05177	515 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	PDHA1	P08559	390 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ITGA4	P13612	1032 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	IL1R1	P14778	569 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	CD19	P15391	556 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	CNTF	P26441	200 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	GNA15	P30679	374 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ATP5O	P48047	213 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	JAM2	P57087	298 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	DSG1	Q02413	1049 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	KLRC3	Q07444	240 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	BNIP1	Q12981	228 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	PPP2R5C	Q13362	524 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	TNFAIP1	Q13829	316 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	DBN1	Q16643	649 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	BBS9	Q3SYG4	887 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	MAML1	Q92585	1016 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	CNKSR1	Q969H4	720 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	LRGUK	Q96M69	825 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	FAM161B	Q96MY7	647 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	EBF2	Q9HAK2	575 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	SLIT2	O94813	1529 aa		3.72	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	UNCX	A6NJT0	531 aa		3.72	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ENO4	A6NNW6	628 aa		3.72	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	PMM2	O15305	246 aa		3.72	□□□□□ -1.81

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