RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591989.5

NEDD4L-233, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 233 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	MTRR	Q9UBK8	725 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	POLI	Q9UNA4	740 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	UST	Q9Y2C2	406 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	TTC26	A0AVF1	554 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCL16	O15467	120 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	GCNT3	O95395	438 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	C1R	P00736	705 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	C8A	P07357	584 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	GAP43	P17677	238 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	ACOT2	P49753	483 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	RAB33A	Q14088	237 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	KCNN1	Q92952	543 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	PANK4	Q9NVE7	773 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
NEDD4L-233	ENST00000591989	CLUH	O75153	1309 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	ANK1	P16157	1881 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989		A0A0B4J269	797 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	SYN3	O14994	580 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	YEATS4	O95619	227 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	GUCY2F	P51841	1108 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	MTMR3	Q13615	1198 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	PKP1	Q13835	747 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	DHX58	Q96C10	678 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	CEP250	Q9BV73	2442 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989		H7C4K7	107 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM189A1	O60320	539 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	CUTA	O60888	179 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	CYP3A5	P20815	502 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	ELF1	P32519	619 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	ME1	P48163	572 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	KCNA1	Q09470	495 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZBTB6	Q15916	424 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	JADE1	Q6IE81	842 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	SHC4	Q6S5L8	630 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	ADSSL1	Q8N142	457 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	BEST2	Q8NFU1	509 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	HVCN1	Q96D96	273 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	SUSD3	Q96L08	255 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	ACCS	Q96QU6	501 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	MYADM	Q96S97	322 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	XYLB	O75191	536 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	FSHR	P23945	695 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	LRPAP1	P30533	357 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	CASP5	P51878	434 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	NTHL1	P78549	312 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	ROR1	Q01973	937 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	POSTN	Q15063	836 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	UVSSA	Q2YD98	709 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	CD302	Q8IX05	232 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	APPL2	Q8NEU8	664 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	KCNK12	Q9HB15	430 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	CFAP45	Q9UL16	551 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		13.43	□□□□□ -0.26

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