RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591417.5

HKR1-222, Transcript of HKR1, GLI-Kruppel zinc finger family member, human

TSL 4 BASIC

Gene HKR1, Length 525 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HKR1-222	ENST00000591417	CCDC169	A6NNP5	214 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	SLC30A4	O14863	429 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	DTNB	O60941	627 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	OR52Z1	P0C646	297 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	MYL4	P12829	197 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	KCNE1	P15382	129 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	FCAR	P24071	287 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	OSTN	P61366	133 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	XKR4	Q5GH76	650 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	ZNF280D	Q6N043	979 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	VIT	Q6UXI7	678 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	SHISA7	A6NL88	538 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	SEC24A	O95486	1093 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	EDN1	P05305	212 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	MCF2	P10911	925 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	CHRNB1	P11230	501 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	TDGF1	P13385	188 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	CPB1	P15086	417 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	CCNE1	P24864	410 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	MCM4	P33991	863 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	ANAPC15	P60006	121 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	TWF1	Q12792	350 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	PLD1	Q13393	1074 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	CSRP2	Q16527	193 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	ST3GAL2	Q16842	350 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	PPM1J	Q5JR12	505 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	NECAB1	Q8N987	351 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	GTF3C6	Q969F1	213 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	RAB34	Q9BZG1	259 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	CIT	O14578	2027 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	WNT7A	O00755	349 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	DPYSL4	O14531	572 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	CHAD	O15335	359 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	VIPR2	P41587	438 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	CCR2	P41597	374 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	FOSB	P53539	338 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	EPHB3	P54753	998 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	PEX3	P56589	373 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	PTGDR	Q13258	359 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	ZNF174	Q15697	407 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	POTEH	Q6S545	545 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	CEP68	Q76N32	757 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	LONP2	Q86WA8	852 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	DDX12P	Q92771	950 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	SUSD3	Q96L08	255 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	CDT1	Q9H211	546 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	POLD4	Q9HCU8	107 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	CEP72	Q9P209	647 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HKR1-222	ENST00000591417	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		12.46	□□□□□ -0.42
HKR1-222	ENST00000591417	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HKR1-222	ENST00000591417	HR	O43593	1189 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HKR1-222	ENST00000591417	FGF19	O95750	216 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HKR1-222	ENST00000591417	ALDH1A3	P47895	512 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HKR1-222	ENST00000591417	FNTB	P49356	437 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HKR1-222	ENST00000591417	EPHA5	P54756	1037 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HKR1-222	ENST00000591417	SATB1	Q01826	763 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HKR1-222	ENST00000591417	STRN3	Q13033	797 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HKR1-222	ENST00000591417	PDIA5	Q14554	519 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HKR1-222	ENST00000591417	TEAD2	Q15562	447 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HKR1-222	ENST00000591417	ME3	Q16798	604 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HKR1-222	ENST00000591417	IL31	Q6EBC2	164 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HKR1-222	ENST00000591417	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HKR1-222	ENST00000591417	CEP120	Q8N960	986 aa		12.45	□□□□□ -0.42

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