RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSCAN32Q9NX65 697 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 SFI1A8K8P3 1242 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 NCAM2O15394 837 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 LILRB5O75023 590 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 MCM4P33991 863 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 ADCY1Q08828 1119 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 SEZ6Q53EL9 994 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT79Q5XKE5 535 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 TPGS2Q68CL5 300 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 HS6ST3Q8IZP7 471 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF687Q8N1G0 1237 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM130Q8N3G9 435 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM184AQ8NB25 1140 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 BORCS6Q96GS4 357 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSWIM3Q96MP5 696 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 ASB16Q96NS5 453 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 NCDNQ9UBB6 729 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 FRYLO94915 3013 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF197O14709 1029 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 MOSPD3O75425 235 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 MICAL2O94851 1124 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 MTAPQ13126 283 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC10A6Q3KNW5 377 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF280DQ6N043 979 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX12PQ92771 950 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D32Q96NH3 1257 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 BRD9Q9H8M2 597 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP72Q9P209 647 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR179Q6PRD1 2367 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 TWF1Q12792 350 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 VITQ6UXI7 678 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 EPC1Q9H2F5 836 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 C17orf75Q9HAS0 396 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-211ENST00000590874 NEFLP07196 543 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 GJA1P17302 382 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP4A22Q5TCH4 519 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 NCANO14594 1321 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 TOM1L1O75674 476 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 IQCEQ6IPM2 695 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP4K3Q8IVH8 894 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 ELMOD1Q8N336 334 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 SMARCD2Q92925 531 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHB8Q9UN66 801 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 COL4A2P08572 1712 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 MYL4P12829 197 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 CPB1P15086 417 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 GUCY2CP25092 1073 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 GDI1P31150 447 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 VIPR2P41587 438 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 STRN3Q13033 797 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 APPL2Q8NEU8 664 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 SPIRE2Q8WWL2 714 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 LAD1O00515 517 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 MAN2B1O00754 1011 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 CXCL8P10145 99 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMC3P17980 439 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 PRPHP41219 470 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 EPHA5P54756 1037 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 SPAG1Q07617 926 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 DTHD1Q6ZMT9 781 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 IRF7Q92985 503 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 TIPINQ9BVW5 301 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 HAPLN2Q9GZV7 340 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 CHRDQ9H2X0 955 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 ASAH2Q9NR71 780 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP4R2Q9NY27 417 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 VNN2O95498 520 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 MAPTP10636 758 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 TDGF1P13385 188 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 PLS3P13797 630 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 MCL1Q07820 350 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM3CQ92520 227 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 PNMA5Q96PV4 448 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 TRPV5Q9NQA5 729 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 MAFFQ9ULX9 164 aa27.97■■■□□ 2.07
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