RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589419.1

CCBE1-204, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

TSL 4

Gene CCBE1, Length 587 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-204ENST00000589419 NUB1Q9Y5A7 615 aa14.88□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 C9IYK1 514 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 ZSCAN12O43309 604 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 EVI5O60447 810 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 NDUFA10O95299 355 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 EOMESO95936 686 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 CST3P01034 146 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 KRT19P08727 400 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 CCDC175P0C221 793 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 FAM189BP81408 668 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 ZNF667Q5HYK9 610 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 AGMOQ6ZNB7 445 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 SLC24A5Q71RS6 500 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 VPS36Q86VN1 386 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 TTC39CQ8N584 583 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 UBR7Q8N806 425 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 LINC01599Q8WXQ3 324 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 CCDC42Q96M95 316 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 ZNF560Q96MR9 790 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 DEF6Q9H4E7 631 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 RSAD1Q9HA92 442 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 CNTN6Q9UQ52 1028 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 ATP8B3O60423 1300 aa14.87□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 ANO9A1A5B4 782 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 PTGESO14684 152 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 LCA5LO95447 670 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 LRPAP1P30533 357 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 PNPLA4P41247 253 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 ASPAP45381 313 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 KIF11P52732 1056 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 MYO1EQ12965 1108 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 GPNMBQ14956 572 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 GLRA4Q5JXX5 417 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 C9orf57Q5W0N0 161 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 SPOPLQ6IQ16 392 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 RSPH1Q8WYR4 309 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 KAT5Q92993 513 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 HPDLQ96IR7 371 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 BCO2Q9BYV7 579 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 WNT8AQ9H1J5 351 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 CYP3A43Q9HB55 503 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 KLK14Q9P0G3 267 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 AGAP1Q9UPQ3 857 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 ADGRG1Q9Y653 693 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 SCN5AQ14524 2016 aa14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 MICAL3Q7RTP6 2002 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 LTBP2Q14767 1821 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 ARL5CA6NH57 179 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 AKR1B10O60218 316 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 CLSTN1O94985 981 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 ACO1P21399 889 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 MLH1P40692 756 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 GUCY2FP51841 1108 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 BPIFB4P59827 614 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 KRT83P78385 493 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 ARID5AQ03989 594 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 GRIK3Q13003 919 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 MTF1Q14872 753 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 TXLNBQ8N3L3 684 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 GAD1Q99259 594 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 CXCL16Q9H2A7 254 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 HAUS4Q9H6D7 363 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 SPTLC3Q9NUV7 552 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 TMEM161AQ9NX61 479 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 UMODL1Q5DID0 1318 aa14.85□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 PIRO00625 290 aa14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 KIAA0355O15063 1070 aa14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 OFD1O75665 1012 aa14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 THP07101 528 aa14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 PAX3P23760 479 aa14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 ZNF132P52740 706 aa14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 PTK2Q05397 1052 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms