RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569151.1

BBS4-216, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 4, human

TSL 3

Gene BBS4, Length 272 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS4-216	ENST00000569151	CD101	Q93033	1021 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	SNF8	Q96H20	258 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	NDN	Q99608	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	SIX2	Q9NPC8	291 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	CHKB	Q9Y259	395 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	CEP350	Q5VT06	3117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151		A0A1W2PRU2	124 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	TLDC2	A0PJX2	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	FSCN2	O14926	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	TBX3	O15119	743 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	TM9SF1	O15321	606 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	CYTH3	O43739	400 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	ATP9A	O75110	1047 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	FKBP6	O75344	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	FAM155B	O75949	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	INHA	P05111	366 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	BMP2	P12643	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	KRT13	P13646	458 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	GAP43	P17677	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	GM2A	P17900	193 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	FGFR4	P22455	802 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	CRABP2	P29373	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	TEC	P42680	631 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	SERPINB4	P48594	390 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	DNA2	P51530	1060 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	IRX4	P78413	519 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	DSG1	Q02413	1049 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	PTP4A2	Q12974	167 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	RCN2	Q14257	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	GRM2	Q14416	872 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	MYBPC3	Q14896	1274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	USH1G	Q495M9	461 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	LIN52	Q52LA3	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	HHAT	Q5VTY9	493 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151		Q6ZVU0	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	TRABD2A	Q86V40	505 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	CHSY1	Q86X52	802 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	TBCK	Q8TEA7	893 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	JADE3	Q92613	823 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	APBB2	Q92870	758 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	STMN2	Q93045	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	TEKT1	Q969V4	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	SLC35C1	Q96A29	364 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	CEP95	Q96GE4	821 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	FAM81B	Q96LP2	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	MBOAT7	Q96N66	472 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	MTFR1L	Q9H019	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS4-216	ENST00000569151	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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