RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR1D2P34982 312 aa18.57■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRT85P78386 507 aa18.57■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTPN21Q16825 1174 aa18.57■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 UVSSAQ2YD98 709 aa18.57■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPATA1Q5VX52 437 aa18.57■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC8B1Q6J4K2 584 aa18.57■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa18.57■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 SYCP3Q8IZU3 236 aa18.57■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 C7orf25Q9BPX7 421 aa18.57■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNH6Q9H252 994 aa18.57■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 TBC1D7Q9P0N9 293 aa18.57■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDY1Q9Y6F8 540 aa18.57■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLUHO75153 1309 aa18.56■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 C2orf16Q68DN1 1984 aa18.56■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 I3L4J1 428 aa18.56■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 RFPL2O75678 378 aa18.56■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 IL18RAPO95256 599 aa18.56■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 LDHAP00338 332 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYBP10242 640 aa18.56■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADSSP30520 456 aa18.56■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 ACOT2P49753 483 aa18.56■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 CASP5P51878 434 aa18.56■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 ASIC1P78348 528 aa18.56■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM132DQ14C87 1099 aa18.56■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 NT5DC4Q86YG4 428 aa18.56■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM212AQ96EL1 285 aa18.56■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 PIDD1Q9HB75 910 aa18.56■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNH3Q9ULD8 1083 aa18.56■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCDHB8Q9UN66 801 aa18.56■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 TISP43B9A030 160 aa18.55■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 M0QZQ0 153 aa18.55■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP18.55■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADAM12O43184 909 aa18.55■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 XYLBO75191 536 aa18.55■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 C8AP07357 584 aa18.55■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 SP100P23497 879 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP18.55■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZXDAP98168 799 aa18.55■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPAG1Q07617 926 aa18.55■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNA1Q09470 495 aa18.55■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPM1LQ5SGD2 360 aa18.55■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 JADE1Q6IE81 842 aa18.55■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF280DQ6N043 979 aa18.55■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPATA32Q96LK8 384 aa18.55■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAFFQ9ULX9 164 aa18.55■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 SORCS3Q9UPU3 1222 aa18.55■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZDHHC9Q9Y397 364 aa18.55■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGEF37A1IGU5 675 aa18.54■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 TBC1D4O60343 1298 aa18.54■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 TPGS2Q68CL5 300 aa18.54■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBALD2Q8IYN6 164 aa18.54■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 CEP57L1Q8IYX8 460 aa18.54■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF461Q8TAF7 563 aa18.54■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP25Q9UHP3 1055 aa18.54■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBE4BO95155 1302 aa18.53■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa18.53■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABLIM3O94929 683 aa18.53■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 NFICP08651 508 aa18.53■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLFN14P0C7P3 912 aa18.53■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 CMA1P23946 247 aa18.53■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 ROR1Q01973 937 aa18.53■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 NHLH1Q02575 133 aa18.53■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 SIGLEC14Q08ET2 396 aa18.53■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 MTMR3Q13615 1198 aa18.53■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 CTXN3Q4LDR2 81 aa18.53■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM26FQ5R3K3 315 aa18.53■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIM67Q6ZTA4 783 aa18.53■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 UNC13DQ70J99 1090 aa18.53■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC7A14Q8TBB6 771 aa18.53■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP18.53■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 FBXL5Q9UKA1 691 aa18.53■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANO9A1A5B4 782 aa18.52■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 OAZ2O95190 189 aa18.52■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 TYMPP19971 482 aa18.52■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 ELF1P32519 619 aa18.52■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 MRE11P49959 708 aa18.52■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 EHHADHQ08426 723 aa18.52■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 C9orf57Q5W0N0 161 aa18.52■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARMCX5Q6P1M9 558 aa18.52■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 DSTYKQ6XUX3 929 aa18.52■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 HFE2Q6ZVN8 426 aa18.52■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa18.52■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 BRSK2Q8IWQ3 736 aa18.52■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 FEZF2Q8TBJ5 459 aa18.52■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 MFSD14AQ96MC6 490 aa18.52■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM213AQ9BRX8 229 aa18.52■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa18.52■□□□□ 0.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 IKZF4Q9H2S9 585 aa18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms