RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHST7Q9NS84 486 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 INTS13Q9NVM9 706 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANO9A1A5B4 782 aa22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 AKAP3O75969 853 aa22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 TNNI1P19237 187 aa22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP1R2P41236 205 aa22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 HYAL1Q12794 435 aa22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 RTP2Q5QGT7 225 aa22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIAA0319Q5VV43 1072 aa22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 NELFBQ8WX92 580 aa22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 PIRO00625 290 aa22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRAPPC3O43617 180 aa22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 LILRB3O75022 631 aa22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 DSG1Q02413 1049 aa22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRRC63Q05C16 580 aa22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 WDR49Q8IV35 697 aa22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 CGRRF1Q99675 332 aa22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 TTPALQ9BTX7 342 aa22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 IRAK3Q9Y616 596 aa22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 ITGB3P05106 788 aa22.64■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 TKTP29401 623 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 STX17P56962 302 aa22.64■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.64■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.64■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.64■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 CETN3O15182 167 aa22.63■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 TNNC2P02585 160 aa22.63■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 FGFR3P22607 806 aa22.63■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 LILRA4P59901 499 aa22.63■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 DLG4P78352 724 aa22.63■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.63■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF516Q92618 1163 aa22.63■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 SUSD3Q96L08 255 aa22.63■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.63■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPTLC1O15269 473 aa22.62■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 KRT19P08727 400 aa22.62■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 CNPP09543 421 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 PAK1Q13153 545 aa22.62■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 DUSP6Q16828 381 aa22.62■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 TTI2Q6NXR4 508 aa22.62■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 CXorf38Q8TB03 319 aa22.62■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.62■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 SIX4Q9UIU6 781 aa22.62■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.62■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa22.62■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAPK13O15264 365 aa22.61■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 LINC01565O15544 149 aa22.61■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.61■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.61■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 XIRP2A4UGR9 3374 aa22.61■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 BICDL2A1A5D9 508 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 RPL17P18621 184 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 VAMP7P51809 220 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 NLRP12P59046 1061 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 DSTYKQ6XUX3 929 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 MLKLQ8NB16 471 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMC2Q8TDI7 906 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 KLHL5Q96PQ7 755 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 TAF6P49848 677 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLDN10P78369 228 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 RBP5P82980 135 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 MKNK1Q9BUB5 465 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLDND1Q9NY35 253 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 M0QZQ0 153 aa22.59■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 SYN3O14994 580 aa22.59■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 TEX28O15482 410 aa22.59■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 KRT13P13646 458 aa22.59■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 KLRC2P26717 231 aa22.59■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 PSMD5Q16401 504 aa22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms