RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563387.5

C15orf40-210, Transcript of chromosome 15 open reading frame 40, humanhuman

TSL 3

Gene C15orf40, Length 419 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40-210ENST00000563387 STON1Q9Y6Q2 735 aa4.71□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 ACEP12821 1306 aa4.71□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 PASKQ96RG2 1323 aa4.71□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 ATP7BP35670 1465 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 NUP155O75694 1391 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 ROBO2Q9HCK4 1378 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 PKD1L3Q7Z443 1732 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 KRBA1A5PL33 1030 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 RCCD1A6NED2 376 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 SMCO2A6NFE2 343 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 CCDC160A6NGH7 325 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 LACTBL1A8MY62 500 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 H3BQV1 296 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 O00370 1275 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 E2F3O00716 465 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 AXIN1O15169 862 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 GPR37O15354 613 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 ZBTB43O43298 467 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 TRAPPC3O43617 180 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 ZBTB14O43829 449 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 LGR5O75473 907 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 FGF18O76093 207 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 RASGRP1O95267 797 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 BPNT1O95861 308 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 NPPAP01160 153 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 PDCP20941 246 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 DNAJB2P25686 324 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 PKLRP30613 574 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 CAP2P40123 477 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 CCNFP41002 786 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 UBA7P41226 1012 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 RASSF2P50749 326 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 CCR3P51677 355 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 NEK4P51957 841 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 ARHGDIBP52566 201 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 LIMK1P53667 647 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 STX17P56962 302 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 NAA20P61599 178 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 RAC1P63000 192 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 OCRLQ01968 901 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 GUCY1A3Q02108 690 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 GRIN1Q05586 938 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 TCEAL1Q15170 157 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 DIXDC1Q155Q3 683 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 OASLQ15646 514 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 GEN1Q17RS7 908 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 RGS21Q2M5E4 152 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 WASHC2DQ5SRD0 308 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 BTBD8Q5XKL5 378 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 SLC4A10Q6U841 1118 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 KDELC1Q6UW63 502 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 OLFM4Q6UX06 510 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 DTHD1Q6ZMT9 781 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 KIF6Q6ZMV9 814 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 DBX2Q6ZNG2 339 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 IDO2Q6ZQW0 420 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 TMTC3Q6ZXV5 915 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 RHOUQ7L0Q8 258 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 FAM83AQ86UY5 434 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 NLRP10Q86W26 655 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 CD302Q8IX05 232 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 AOPEPQ8N6M6 819 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 MINDY2Q8NBR6 621 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 ATAD1Q8NBU5 361 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 GALNT11Q8NCW6 608 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 TTLQ8NG68 377 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 OR8H1Q8NGG4 311 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 OR52K2Q8NGK3 314 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 LRRC8CQ8TDW0 803 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 SNX29Q8TEQ0 813 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 GAB3Q8WWW8 586 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 SLC7A3Q8WY07 619 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 RAPGEF5Q92565 580 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 NELL1Q92832 810 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 CAVIN3Q969G5 261 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 TTC17Q96AE7 1141 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 FAM167AQ96KS9 214 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf40-210ENST00000563387 AIFM3Q96NN9 605 aa4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms