RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 CLUHO75153 1309 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 THP07101 528 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 KCNE1P15382 129 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 TNFSF9P41273 254 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 TUSC3Q13454 348 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 PIDD1Q9HB75 910 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 CNTN3Q9P232 1028 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 ADAM28Q9UKQ2 775 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 CFAP54Q96N23 3096 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 OGTO15294 1046 aa21.81■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 ADRB2P07550 413 aa21.81■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 CLTAP09496 248 aa21.81■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 ALCAMQ13740 583 aa21.81■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 FUT10Q6P4F1 479 aa21.81■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 SIX5Q8N196 739 aa21.81■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 ACCSQ96QU6 501 aa21.81■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 ANK1P16157 1881 aa21.81■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 TTC26A0AVF1 554 aa21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 PRR23AA6NEV1 266 aa21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 CASTOR2A6NHX0 329 aa21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 TADA2AO75478 443 aa21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 CXCL8P10145 99 aa21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 NPR3P17342 541 aa21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 YARSP54577 528 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM26FQ5R3K3 315 aa21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 CD300LGQ6UXG3 332 aa21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC105Q8IYK2 499 aa21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 FEZF2Q8TBJ5 459 aa21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 MSTO1Q9BUK6 570 aa21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF202O95125 648 aa21.79■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 RFX1P22670 979 aa21.79■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 FOXK2Q01167 660 aa21.79■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 KRBA2Q6ZNG9 492 aa21.79■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 ASCL5Q7RTU5 278 aa21.79■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 PALB2Q86YC2 1186 aa21.79■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa21.79■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 ENGASEQ8NFI3 743 aa21.79■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 GPR62Q9BZJ7 368 aa21.79■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 PRKD2Q9BZL6 878 aa21.79■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa21.79■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.79■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.088e-6■■■■■ 107
RABGGTA-210ENST00000559586 C2orf16Q68DN1 1984 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 STK25O00506 426 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 TGM5O43548 720 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 RFPL2O75678 378 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 KIF4AO95239 1232 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 PRR29P0C7W0 189 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 SRFP11831 508 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 ZBTB6Q15916 424 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 LILRA6Q6PI73 481 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM130Q8N3G9 435 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC44A3Q8N4M1 653 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 DTWD2Q8NBA8 298 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF507Q8TCN5 953 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 SCFD1Q8WVM8 642 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM186AA6NE01 2351 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 MYO15AQ9UKN7 3530 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 PLXNA3P51805 1871 aa21.77■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 VWA8A3KMH1 1905 aa21.77■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 ACOT2P49753 483 aa21.77■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 KYAT1Q16773 422 aa21.77■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 SLFN12LQ6IEE8 588 aa21.77■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 PDXDC1Q6P996 788 aa21.77■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 FRMD5Q7Z6J6 570 aa21.77■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 EXOC7Q9UPT5 735 aa21.77■■□□□ 1.08
RABGGTA-210ENST00000559586 LACTBL1A8MY62 500 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-210ENST00000559586 PI15O43692 258 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-210ENST00000559586 CFHP08603 1231 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-210ENST00000559586 SPATA31D3P0C874 917 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-210ENST00000559586 LAMP2P13473 410 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-210ENST00000559586 CLCNKBP51801 687 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-210ENST00000559586 SPAG1Q07617 926 aa21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms