RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 ADSSL1Q8N142 457 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 HLA-CQ95604 372 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 IGFLR1Q9H665 355 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 CLDND1Q9NY35 253 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 THEGQ9P2T0 379 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 ITGA11Q9UKX5 1188 aa20.41■□□□□ 0.86
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RABGGTA-208ENST00000558954 PER2O15055 1255 aa20.4■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 ADH1AP07327 375 aa20.4■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 SRGAP2BP0DMP2 458 aa20.4■□□□□ 0.86
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RABGGTA-208ENST00000558954 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.86
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RABGGTA-208ENST00000558954 RTP2Q5QGT7 225 aa20.4■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 C2orf16Q68DN1 1984 aa20.4■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 CENPPQ6IPU0 288 aa20.4■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM130Q8N3G9 435 aa20.4■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 GPT2Q8TD30 523 aa20.4■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 PIK3R5Q8WYR1 880 aa20.4■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.4■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 SUSD3Q96L08 255 aa20.4■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF560Q96MR9 790 aa20.4■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 CGRRF1Q99675 332 aa20.4■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 INTS13Q9NVM9 706 aa20.4■□□□□ 0.86
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RABGGTA-208ENST00000558954 I3L4J1 428 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 PIRO00625 290 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 SYN3O14994 580 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 MAPK13O15264 365 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 LILRB3O75022 631 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 TNNI1P19237 187 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 BMP6P22004 513 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 PNPLA4P41247 253 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 PSMD5Q16401 504 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 DUOXA2Q1HG44 320 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 EP400NLQ6ZTU2 488 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 USP37Q86T82 979 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 C1orf127Q8N9H9 656 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 ARHGEF37A1IGU5 675 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 M0QZQ0 153 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 PPEF2O14830 753 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 ITGB3P05106 788 aa20.38■□□□□ 0.85
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RABGGTA-208ENST00000558954 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
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RABGGTA-208ENST00000558954 NDUFV1P49821 464 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 TAF6P49848 677 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 LILRA4P59901 499 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 ADAM9Q13443 819 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 KLHL10Q6JEL2 608 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 ANKS3Q6ZW76 656 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 RXFP1Q9HBX9 757 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 FNIP2Q9P278 1114 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 BICDL2A1A5D9 508 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 TEX28O15482 410 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 LINC01565O15544 149 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 TBX10O75333 385 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 GLP2RO95838 553 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 CD44P16070 742 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 KLRC2P26717 231 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 ADAM15Q13444 863 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 SV2CQ496J9 727 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM186BQ8IYM0 893 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 LRRC52Q8N7C0 313 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 APPL2Q8NEU8 664 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 OR5B17Q8NGF7 314 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 KLHL5Q96PQ7 755 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 PRDM6Q9NQX0 595 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 MTRRQ9UBK8 725 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 PCDHB8Q9UN66 801 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 TRIM49BA6NDI0 452 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 CETN3O15182 167 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 AKAP3O75969 853 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 KRT19P08727 400 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
RABGGTA-208ENST00000558954 ODC1P11926 461 aa20.36■□□□□ 0.85
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