RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557143.1

KLC1-222, Transcript of kinesin light chain 1, human

TSL 2

Gene KLC1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KLC1-222	ENST00000557143	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	ZBTB6	Q15916	424 aa		13.14	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	LILRA6	Q6PI73	481 aa		13.14	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	RNF135	Q8IUD6	432 aa		13.14	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		13.14	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		13.14	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		13.14	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		13.14	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		13.14	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	13.13	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143		A0A1B0GVL5	298 aa		13.13	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	CARNS1	A5YM72	827 aa		13.13	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		13.13	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143		H0YCG3	227 aa		13.13	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	GCNT3	O95395	438 aa		13.13	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	FGFR3	P22607	806 aa		13.13	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	AFM	P43652	599 aa		13.13	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		13.13	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	SAAL1	Q96ER3	474 aa		13.13	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		13.13	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	TRIM9	Q9C026	710 aa		13.13	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		13.13	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		13.13	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		13.13	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		13.13	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	FAM50B	Q9Y247	325 aa		13.13	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		13.12	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		13.12	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	CFH	P08603	1231 aa		13.12	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	NFIC	P08651	508 aa		13.12	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	GAP43	P17677	238 aa		13.12	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	OR1D2	P34982	312 aa		13.12	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	CDR1	P51861	262 aa		13.12	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	CUL4B	Q13620	913 aa		13.12	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	PSMD5	Q16401	504 aa		13.12	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	ADAL	Q6DHV7	355 aa		13.12	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	JADE1	Q6IE81	842 aa		13.12	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		13.12	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	PRR14	Q9BWN1	585 aa		13.12	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		13.12	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	FNIP2	Q9P278	1114 aa		13.12	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		13.12	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	SPTLC1	O15269	473 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	GLUD1	P00367	558 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	ADH1A	P07327	375 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	ADRB2	P07550	413 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	ASIC1	P78348	528 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	ATL3	Q6DD88	541 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	GPR149	Q86SP6	731 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	IQUB	Q8NA54	791 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	UROC1	Q96N76	676 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	ACCS	Q96QU6	501 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	TNMD	Q9H2S6	317 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	CFAP45	Q9UL16	551 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	PFKFB1	P16118	471 aa		13.1	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	NTHL1	P78549	312 aa		13.1	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	ITIH3	Q06033	890 aa		13.1	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		13.1	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	CES5A	Q6NT32	575 aa		13.1	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		13.1	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		13.1	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	SPATA32	Q96LK8	384 aa		13.1	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		13.1	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		13.1	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		13.1	□□□□□ -0.31
KLC1-222	ENST00000557143	STK39	Q9UEW8	545 aa		13.1	□□□□□ -0.31

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms