RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555578.1

LINC00638-201, long intergenic non-protein coding RNA 638, humanhuman

BASIC

Gene LINC00638, Length 2,518 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00638-201ENST00000555578 ISCUQ9H1K1 167 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 HES2Q9Y543 173 aa14.95□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 ZEB2O60315 1214 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 TSPAN1O60635 241 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 ERLIN2O94905 339 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 INHBEP58166 350 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 MFSD10Q14728 455 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 SPATA4Q8NEY3 305 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 HDAC7Q8WUI4 952 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 APBA2Q99767 749 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 INTUQ9ULD6 942 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 RTN2O75298 545 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 KIF4AO95239 1232 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 PGK1P00558 417 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 ASS1P00966 412 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 TUBBP07437 444 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 COL1A2P08123 1366 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 CYP2C9P11712 490 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 PRLRP16471 622 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 TRPC3Q13507 836 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 ZSCAN26Q16670 478 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 JADE1Q6IE81 842 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 VTI1AQ96AJ9 217 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 CYFIP2Q96F07 1278 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 NFKBIZQ9BYH8 718 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 PSD3Q9NYI0 1048 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 POLIQ9UNA4 740 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 TRIP11Q15643 1979 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 RAP1GAPP47736 663 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 SLC7A5Q01650 507 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 ENPEPQ07075 957 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 SREBF2Q12772 1141 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 ORC1Q13415 861 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 CASP8Q14790 479 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 SLC10A6Q3KNW5 377 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 NT5DC3Q86UY8 548 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 CCDC102AQ96A19 550 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 IMPG2Q9BZV3 1241 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 VPS18Q9P253 973 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 ANK1P16157 1881 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 LMAN1P49257 510 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 FLT3LGP49771 235 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 CDH8P55286 799 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 GPC5P78333 572 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 NAA35Q5VZE5 725 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 TMEM40Q8WWA1 233 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 TRIB2Q92519 343 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 AP5M1Q9H0R1 490 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 NCANO14594 1321 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 KIF3CO14782 793 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 CA12O43570 354 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 CEP104O60308 925 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 GPR32O75388 356 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 PSEN2P49810 448 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 MESDQ14696 234 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 WDR93Q6P2C0 686 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 C1orf127Q8N9H9 656 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 ZNF653Q96CK0 615 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 LRRC1Q9BTT6 524 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 TRIM7Q9C029 511 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 ADAMTS10Q9H324 1103 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 SIX4Q9UIU6 781 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 NRCAMQ92823 1304 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 ITGB3P05106 788 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 GNA15P30679 374 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 PAFAH1B1P43034 410 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 TM4SF4P48230 202 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 FAM187BQ17R55 369 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 SLFN11Q7Z7L1 901 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 TAF4BQ92750 862 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 XYLT2Q9H1B5 865 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.91□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 THAP12O43422 761 aa14.91□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 B4GALT4O60513 344 aa14.91□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 TNNC2P02585 160 aa14.91□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 GZMAP12544 262 aa14.91□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 POU5F1BQ06416 359 aa14.91□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 ZNF699Q32M78 642 aa14.91□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 WDR72Q3MJ13 1102 aa14.91□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 GNASQ5JWF2 1037 aa14.91□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 AADACL2Q6P093 401 aa14.91□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 CATSPER4Q7RTX7 472 aa14.91□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
LINC00638-201ENST00000555578 SOCS4Q8WXH5 440 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms