RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551676.5

PPP1CC-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, human

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CC-208	ENST00000551676	BPIFB4	P59827	614 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	SLC35F6	Q8N357	371 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	KIF12	Q96FN5	646 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	KBTBD13	C9JR72	458 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	GPR182	O15218	404 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	ITGB3	P05106	788 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	CDR2	Q01850	454 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	DPP3	Q9NY33	737 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	ARVCF	O00192	962 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	IPP	Q9Y573	584 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	DNM1L	O00429	736 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	KRT19	P08727	400 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	KCNE1	P15382	129 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	ASPA	P45381	313 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	PDE6C	P51160	858 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF132	P52740	706 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	RBP5	P82980	135 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	H2AFV	Q71UI9	128 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	ACP6	Q9NPH0	428 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	AKAP5	P24588	427 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	FMO1	Q01740	532 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF677	Q86XU0	584 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	PALB2	Q86YC2	1186 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	RNF39	Q9H2S5	420 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	CDK7	P50613	346 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	GUCY2F	P51841	1108 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	LPIN1	Q14693	890 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	BCO2	Q9BYV7	579 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	ISCU	Q9H1K1	167 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	PADI3	Q9ULW8	664 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	TMEM270	Q6UE05	265 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	USP38	Q8NB14	1042 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	BEST2	Q8NFU1	509 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	APOL6	Q9BWW8	343 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	CIT	O14578	2027 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	MME	P08473	750 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	GZMA	P12544	262 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	TERF1	P54274	439 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	GALC	P54803	685 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	DSC3	Q14574	896 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	MTFR1	Q15390	333 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	TAF3	Q5VWG9	929 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	HPDL	Q96IR7	371 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	CISH	Q9NSE2	258 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	PARP2	Q9UGN5	583 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	CTAGE9	A4FU28	777 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	TACC1	O75410	805 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	GHR	P10912	638 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	CKB	P12277	381 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	CCL5	P13501	91 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	CD52	P31358	61 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	TRIM58	Q8NG06	486 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	NOX5	Q96PH1	765 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	DEFB118	Q96PH6	123 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	POLI	Q9UNA4	740 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
PPP1CC-208	ENST00000551676	CLSTN1	O94985	981 aa		27.54	■■■□□ 2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms