RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 MCRS1Q96EZ8 462 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 TUBB6Q9BUF5 446 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 STARD7Q9NQZ5 370 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SENP1Q9P0U3 644 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CYTH4Q9UIA0 394 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 C16orf96A6NNT2 1141 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 H7C4K7 107 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 DNAJC6O75061 913 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 FSBPO95073 299 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CSPG5O95196 566 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 AKR1A1P14550 325 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SERPINB1P30740 379 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 VEGFBP49765 207 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 RAD23BP54727 409 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SPDYE2Q495Y8 402 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ALFQ53S48 1182 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CNGA4Q8IV77 575 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CDC26Q8NHZ8 85 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CORO1BQ9BR76 489 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 COLEC11Q9BWP8 271 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 KCNH3Q9ULD8 1083 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SNX14Q9Y5W7 946 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 STON1Q9Y6Q2 735 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 KRT86O43790 486 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV5-2P06315 115 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SOX11P35716 441 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ACADVLP49748 655 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 USP11P51784 963 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 NR1H3Q13133 447 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ANKDD1AQ495B1 522 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 KIRREL3Q8IZU9 778 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SMYD1Q8NB12 490 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM10Q9UDY6 481 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PRKAB1Q9Y478 270 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 FAM25AB3EWG3 89 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 FAM25CB3EWG5 89 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 FAM25GB3EWG6 89 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 GPR182O15218 404 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 IFNAR1P17181 557 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 KRT15P19012 456 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 AKR1D1P51857 326 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PSMC5P62195 406 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PAK1Q13153 545 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PLD1Q13393 1074 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 RCN2Q14257 317 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ACAP1Q15027 740 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ASIC2Q16515 512 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 P3H1Q32P28 736 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 BBS9Q3SYG4 887 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 BORAQ6PGQ7 559 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CTAGE3PQ8IX95 158 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SPARTQ8N0X7 666 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD42Q8N9B4 389 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC8CQ8TDW0 803 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 KCTD4Q8WVF5 259 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PIGSQ96S52 555 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 KLF15Q9UIH9 416 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 C17orf102A2RUQ5 167 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PI4K2BG5E9Z4 385 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 K7ERI5 159 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 P4HBP07237 508 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 OCM2P0CE71 109 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 RXRAP19793 462 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CA4P22748 312 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PRDX5P30044 214 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 HOXC8P31273 242 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 GABPAQ06546 454 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PUDPQ08623 228 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PTGDRQ13258 359 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 DENND2CQ68D51 928 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 FRA10AC1Q70Z53 315 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM69Q86WT6 500 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 RNF135Q8IUD6 432 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SYCE1Q8N0S2 351 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 RDH13Q8NBN7 331 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CATSPER1Q8NEC5 780 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 MAML1Q92585 1016 aa6.63□□□□□ -1.35
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