RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 HOXD13P35453 343 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 SNX16P57768 344 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 ZBED6P86452 979 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 FAAP100Q0VG06 881 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 CEP120Q8N960 986 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM161AQ9NX61 479 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 CEP72Q9P209 647 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 POMCP01189 267 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 ALDH2P05091 517 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 HOXC8P31273 242 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 MLH1P40692 756 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 MFSD5Q6N075 450 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 OR6B3Q8NGW1 331 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 TSC1Q92574 1164 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 LPPQ93052 612 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 UROC1Q96N76 676 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 NOX5Q96PH1 765 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 SYNCQ9H7C4 482 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 IL23AQ9NPF7 189 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-210ENST00000544244 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 SCNN1GP51170 649 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 GRIK3Q13003 919 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 CYP26C1Q6V0L0 522 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 TMTC1Q8IUR5 882 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 HELQQ8TDG4 1101 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 RGS18Q9NS28 235 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 HESX1Q9UBX0 185 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 SNX9Q9Y5X1 595 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 ENPP3O14638 875 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 KIAA0355O15063 1070 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF623O75123 536 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 B3GAT3O94766 335 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 ACRP10323 421 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 CSF2RAP15509 400 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 CD58P19256 250 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 CASP14P31944 242 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 RPL9P32969 192 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 NOP14P78316 857 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 RBL2Q08999 1139 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 MGAT3Q09327 533 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 APPL2Q8NEU8 664 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 KCNN1Q92952 543 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 SNX27Q96L92 541 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 FBXL18Q96ME1 805 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 MED10Q9BTT4 135 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 UMODL1Q5DID0 1318 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 ZSCAN12O43309 604 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 MED7O43513 233 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 NFICP08651 508 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 SYN1P17600 705 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 SLC9A1P19634 815 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 PDE6CP51160 858 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 ADKP55263 362 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 KRT17Q04695 432 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 PPP3CAQ08209 521 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 TAS1R2Q8TE23 839 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 WNT8BQ93098 351 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 ATP8B3O60423 1300 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 ITIH6Q6UXX5 1313 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 LRRN2O75325 713 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 SKILP12757 684 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 CD46P15529 392 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 CYP3A5P20815 502 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 TIE1P35590 1138 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 MYL6P60660 151 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 DLG4P78352 724 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRO-210ENST00000544244 KRT83P78385 493 aa6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms