RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531474.2

NXF1-209, Transcript of nuclear RNA export factor 1, human

TSL 3

Gene NXF1, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NXF1-209	ENST00000531474	MLH1	P40692	756 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	KLK7	P49862	253 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	CYP2J2	P51589	502 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	VAV2	P52735	878 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	KYAT1	Q16773	422 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	TMEM192	Q8IY95	271 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	URGCP	Q8TCY9	931 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	UBXN4	Q92575	508 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	SLC35C1	Q96A29	364 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	SAAL1	Q96ER3	474 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	BORCS6	Q96GS4	357 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	SPAG5	Q96R06	1193 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	GAD1	Q99259	594 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	RAD9A	Q99638	391 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	RNF19A	Q9NV58	838 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	CDC23	Q9UJX2	597 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	ATP8B3	O60423	1300 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	ANO9	A1A5B4	782 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	PJA2	O43164	708 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	EXTL3	O43909	919 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	TACC1	O75410	805 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	NOL4	O94818	638 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	CLTA	P09496	248 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	CXCL8	P10145	99 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	MYOG	P15173	224 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	PON1	P27169	355 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	PBX2	P40425	430 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	TNFSF9	P41273	254 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	ARHGAP25	P42331	645 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	MAGEA1	P43355	309 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	ACOT2	P49753	483 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	KIF11	P52732	1056 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	RAB30	Q15771	203 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	ASIC2	Q16515	512 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	TRIM58	Q8NG06	486 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	ANKRD7	Q92527	254 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	ACAP3	Q96P50	834 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	WDR24	Q96S15	920 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	MSRA	Q9UJ68	235 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	INSL6	Q9Y581	213 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	LCHN	A4D1U4	455 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	ARL5C	A6NH57	179 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	FAM189A1	O60320	539 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	CA3	P07451	260 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	UCHL3	P15374	230 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	PRLR	P16471	622 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	FER	P16591	822 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	PRKCI	P41743	596 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	STAT1	P42224	750 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	FMO5	P49326	533 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	SCNN1G	P51170	649 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	BFSP1	Q12934	665 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	LRRC43	Q8N309	656 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NXF1-209	ENST00000531474	GPD1L	Q8N335	351 aa		10.17	□□□□□ -0.78

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