RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 AKNAD1Q5T1N1 836 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 UROC1Q96N76 676 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 ASB6Q9NWX5 421 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 GPR39O43194 453 aa6.6□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 FOXF2Q12947 444 aa6.6□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.6□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.6□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 WDR66Q8TBY9 1149 aa6.6□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 A0A1W2PS29 197 aa6.59□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 TLDC2A0PJX2 215 aa6.59□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 CCDC151A5D8V7 595 aa6.59□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 YY2O15391 372 aa6.59□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 CTXN1P60606 82 aa6.59□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 RHOT1Q8IXI2 618 aa6.59□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 Q8NA96 180 aa6.59□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 SRGNP10124 158 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 AGXTP21549 392 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 ERVK-21P61565 698 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 NBPF8Q3BBV2 869 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 VWA1Q6PCB0 445 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 AMOTL1Q8IY63 956 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 SSH1Q8WYL5 1049 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 DPF2Q92785 391 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 TMEM125Q96AQ2 219 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 IL17RBQ9NRM6 502 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 INTS13Q9NVM9 706 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa6.58□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.57□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 MPPED1O15442 326 aa6.57□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 PRAMEF10O60809 474 aa6.57□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 KCNA2P16389 499 aa6.57□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 CNGA1P29973 690 aa6.57□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 KAZNQ674X7 775 aa6.57□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 COG1Q8WTW3 980 aa6.57□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 NRG4Q8WWG1 115 aa6.57□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 INTUQ9ULD6 942 aa6.57□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 CDYLQ9Y232 598 aa6.57□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 PROM1O43490 865 aa6.56□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 MAPK10P53779 464 aa6.56□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 RPS7P62081 194 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 ZNF844Q08AG5 666 aa6.56□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.56□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.56□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 KRT26Q7Z3Y9 468 aa6.56□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 RSPH3Q86UC2 560 aa6.56□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.56□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 FBXL20Q96IG2 436 aa6.56□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 TIMP4Q99727 224 aa6.56□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 TLR10Q9BXR5 811 aa6.56□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 K7ESF4 209 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 AGFG2O95081 481 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 GPD1P21695 349 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 SLC6A4P31645 630 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 GRIA3P42263 894 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 WASP42768 502 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 ABCG1P45844 678 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 PROK1P58294 105 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 FPGSQ05932 587 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 EPHA10Q5JZY3 1008 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 PTF1AQ7RTS3 328 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 PPM1NQ8N819 430 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 ANKS1AQ92625 1134 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 SARAFQ96BY9 339 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 TMX3Q96JJ7 454 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 CPNE5Q9HCH3 593 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 TDP1Q9NUW8 608 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.54□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 GRM6O15303 877 aa6.54□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 SDE2Q6IQ49 451 aa6.54□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.54□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 TFAP2BQ92481 460 aa6.54□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa6.54□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 TRIM75PA6NK02 468 aa6.53□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 ERBB2P04626 1255 aa6.53□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 VIL1P09327 827 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
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