RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520462.5

TSNARE1-206, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSNARE1, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-206ENST00000520462 KIF20AO95235 890 aa16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 ADH1AP07327 375 aa16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 CYP3A5P20815 502 aa16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 DSG1Q02413 1049 aa16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 CREMQ03060 361 aa16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 SIGLEC14Q08ET2 396 aa16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 TMEM132DQ14C87 1099 aa16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 PTPN21Q16825 1174 aa16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 IER5LQ5T953 404 aa16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 JADE1Q6IE81 842 aa16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 CES5AQ6NT32 575 aa16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 PDXDC1Q6P996 788 aa16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 GPD1LQ8N335 351 aa16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 FBXL6Q8N531 539 aa16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 SCFD1Q8WVM8 642 aa16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 TTPALQ9BTX7 342 aa16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 CHST7Q9NS84 486 aa16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 DERAQ9Y315 318 aa16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF318Q5VUA4 2279 aa16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 KINO60870 393 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 EFEMP2O95967 443 aa16.74■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 ADRB2P07550 413 aa16.74■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 MCM4P33991 863 aa16.74■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 DPYDQ12882 1025 aa16.74■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 BMT2Q1RMZ1 405 aa16.74■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 KIAA0319Q5VV43 1072 aa16.74■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 BRSK2Q8IWQ3 736 aa16.74■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 GPR65Q8IYL9 337 aa16.74■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 PRSS33Q8NF86 280 aa16.74■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 GOLGA5Q8TBA6 731 aa16.74■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 B3GALT6Q96L58 329 aa16.74■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 KLHL5Q96PQ7 755 aa16.74■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 KIAA1586Q9HCI6 787 aa16.74■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF233A6NK53 670 aa16.73■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 LILRB3O75022 631 aa16.73■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 RHOBTB3O94955 611 aa16.73■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 NFICP08651 508 aa16.73■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 CNPP09543 421 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 LRPAP1P30533 357 aa16.73■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 HOXD13P35453 343 aa16.73■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 BRCC3P46736 316 aa16.73■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 PTPN5P54829 565 aa16.73■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 STK4Q13043 487 aa16.73■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 ZBTB6Q15916 424 aa16.73■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 SPATA1Q5VX52 437 aa16.73■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa16.73■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 NT5DC4Q86YG4 428 aa16.73■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 ENGASEQ8NFI3 743 aa16.73■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 TIGD1Q96MW7 591 aa16.73■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa16.73■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 RMND1Q9NWS8 449 aa16.73■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 HSPBP1Q9NZL4 362 aa16.73■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 C2CD2Q9Y426 696 aa16.73■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 NR2E1Q9Y466 385 aa16.73■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 PLXNA3P51805 1871 aa16.72■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 CLIC2O15247 247 aa16.72■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 SMC2O95347 1197 aa16.72■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 WEE2P0C1S8 567 aa16.72■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 CYP2J2P51589 502 aa16.72■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 PNOCQ13519 176 aa16.72■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 KCNB1Q14721 858 aa16.72■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 SURF1Q15526 300 aa16.72■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 PSMD5Q16401 504 aa16.72■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 RTP2Q5QGT7 225 aa16.72■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 KIAA0895Q8NCT3 520 aa16.72■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 C3orf58Q8NDZ4 430 aa16.72■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 PIK3R5Q8WYR1 880 aa16.72■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 ADAM7Q9H2U9 754 aa16.72■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 POMKQ9H5K3 350 aa16.72■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 RXFP1Q9HBX9 757 aa16.72■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 DZANK1Q9NVP4 752 aa16.72■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 FNIP2Q9P278 1114 aa16.72■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 DPP7Q9UHL4 492 aa16.72■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 I3L4J1 428 aa16.71■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 TEX28O15482 410 aa16.71■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 TGFB1I1O43294 461 aa16.71■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 FGFR3P22607 806 aa16.71■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 GUCY2FP51841 1108 aa16.71■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 ITIH3Q06033 890 aa16.71■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 GLYCTKQ8IVS8 523 aa16.71■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 XXYLT1Q8NBI6 393 aa16.71■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 KREMEN2Q8NCW0 462 aa16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms