RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519617.1

CCNC-208, Transcript of cyclin C, human

TSL 3

Gene CCNC, Length 246 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNC-208	ENST00000519617	GPANK1	O95872	356 aa		2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	PTPN7	P35236	360 aa		2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	LSS	P48449	732 aa		2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	NEK4	P51957	841 aa		2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	VAV2	P52735	878 aa		2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	LGALS4	P56470	323 aa		2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	SP140	Q13342	867 aa		2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	MST1L	Q2TV78	715 aa		2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	GGT6	Q6P531	493 aa		2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	REPS2	Q8NFH8	660 aa		2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	BCO1	Q9HAY6	547 aa		2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	ASB6	Q9NWX5	421 aa		2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	TMEM260	Q9NX78	707 aa		2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	NUP155	O75694	1391 aa		2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	AGL	P35573	1532 aa		2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	WDR91	A4D1P6	747 aa		2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	WNT10B	O00744	389 aa		2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	KCNAB3	O43448	404 aa		2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	KDM1A	O60341	852 aa		2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	POMC	P01189	267 aa		2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	CELA2A	P08217	269 aa		2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	FOLR3	P41439	243 aa		2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	SCNN1B	P51168	640 aa		2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	RAP2B	P61225	183 aa		2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	HSD11B2	P80365	405 aa		2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	NFE2L2	Q16236	605 aa		2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	RASSF3	Q86WH2	238 aa		2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	OR7D4	Q8NG98	312 aa		2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	DPF1	Q92782	380 aa		2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	SARAF	Q96BY9	339 aa		2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	MRI1	Q9BV20	369 aa		2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	NAIP	Q13075	1403 aa		2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	RICTOR	Q6R327	1708 aa		2.56	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	CCDC151	A5D8V7	595 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617		E9PSI1	815 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	PEX1	O43933	1283 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	RAB11FIP3	O75154	756 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	PRSS23	O95084	383 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	LPL	P06858	475 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	CKB	P12277	381 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	SOX10	P56693	466 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	CT83	Q5H943	113 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	BROX	Q5VW32	411 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	AFMID	Q63HM1	303 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617		Q6ZVL8	140 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	GPR156	Q8NFN8	814 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	HASPIN	Q8TF76	798 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	TONSL	Q96HA7	1378 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		2.55	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	USP25	Q9UHP3	1055 aa		2.55	□□□□□ -2

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