RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
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TRPS1-206ENST00000517323 ENPP3O14638 875 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPS1-206ENST00000517323 UPP2O95045 317 aa16.68■□□□□ 0.26
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TRPS1-206ENST00000517323 WDR72Q3MJ13 1102 aa16.68■□□□□ 0.26
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TRPS1-206ENST00000517323 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
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TRPS1-206ENST00000517323 ZNF263O14978 683 aa16.64■□□□□ 0.25
TRPS1-206ENST00000517323 DDHD2O94830 711 aa16.64■□□□□ 0.25
TRPS1-206ENST00000517323 THP07101 528 aa16.64■□□□□ 0.25
TRPS1-206ENST00000517323 CFHP08603 1231 aa16.64■□□□□ 0.25
TRPS1-206ENST00000517323 ACO1P21399 889 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
TRPS1-206ENST00000517323 RAB27AP51159 221 aa16.64■□□□□ 0.25
TRPS1-206ENST00000517323 AP3M2P53677 418 aa16.64■□□□□ 0.25
TRPS1-206ENST00000517323 TMEM270Q6UE05 265 aa16.64■□□□□ 0.25
TRPS1-206ENST00000517323 BEST2Q8NFU1 509 aa16.64■□□□□ 0.25
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