RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516226.1

RNU6-397P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 397, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-397P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-397P-201ENST00000516226 CDC45O75419 566 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 CBSLP0DN79 551 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 KCNA2P16389 499 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC6A2P23975 617 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 ITPKBP27987 946 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 CBSP35520 551 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 MCAMP43121 646 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 GRM1Q13255 1194 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 MTX3Q5HYI7 312 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 TSTD2Q5T7W7 516 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 Q8NA96 180 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 DPF1Q92782 380 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 ALG8Q9BVK2 526 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 FANCLQ9NW38 375 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 HSFX1Q9UBD0 423 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC23A1Q9UHI7 598 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 CDHR4A6H8M9 788 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 NEMP1O14524 444 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 URI1O94763 535 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 IGKV2-30P06310 120 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 PIGFQ07326 219 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLFN5Q08AF3 891 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF844Q08AG5 666 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 MTM1Q13496 603 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 TKFCQ3LXA3 575 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC44A4Q53GD3 710 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 C11orf87Q6NUJ2 197 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 KCNK18Q7Z418 384 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 VGLL2Q8N8G2 317 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 CLRN3Q8NCR9 226 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 SSH1Q8WYL5 1049 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 UBXN4Q92575 508 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 PBKQ96KB5 322 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 HAPLN3Q96S86 360 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 GSTO2Q9H4Y5 243 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 EDARQ9UNE0 448 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 CCDC78A2IDD5 438 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 BRINP1O60477 761 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 PDE8AO60658 829 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRSS23O95084 383 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 TTLL1O95922 423 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 FCER1AP12319 257 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 DDCP20711 480 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 CCT4P50991 539 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 CTXN1P60606 82 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 NOMO3P69849 1222 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 FPGSQ05932 587 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 PPP3CAQ08209 521 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 LAMB3Q13751 1172 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 NOMO1Q15155 1222 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 TXNRD1Q16881 649 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 NOMO2Q5JPE7 1267 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 PLAC9Q5JTB6 97 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC9A4Q6AI14 798 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 NEK8Q86SG6 692 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 TBC1D15Q8TC07 691 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 LMBR1Q8WVP7 490 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 SNX19Q92543 992 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 TMEM125Q96AQ2 219 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 ADGRE3Q9BY15 652 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 PADI4Q9UM07 663 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 BTBD3Q9Y2F9 522 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 ACTL7AQ9Y615 435 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 AOX1Q06278 1338 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 WDR27A2RRH5 827 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 LINC00473A8K010 186 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 ADM5C9JUS6 153 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 TRIM38O00635 465 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 MOSPD3O75425 235 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 ANXA1P04083 346 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRR35P0CG20 571 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 FPR1P21462 350 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 KELP23276 732 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 PCSK1P29120 753 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 ATP8B2P98198 1209 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 DYRK1AQ13627 763 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 CCDC144BQ3MJ40 725 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 AOPEPQ8N6M6 819 aa3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms